Protein–RNA interactions for Protein: P49642

PRIM1, DNA primase small subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRIM1P49642 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRIM1P49642 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRIM1P49642 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRIM1P49642 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRIM1P49642 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRIM1P49642 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRIM1P49642 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRIM1P49642 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRIM1P49642 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRIM1P49642 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
PRIM1P49642 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRIM1P49642 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRIM1P49642 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRIM1P49642 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRIM1P49642 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRIM1P49642 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
PRIM1P49642 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRIM1P49642 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRIM1P49642 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRIM1P49642 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
PRIM1P49642 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
PRIM1P49642 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRIM1P49642 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRIM1P49642 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRIM1P49642 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
PRIM1P49642 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRIM1P49642 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRIM1P49642 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRIM1P49642 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRIM1P49642 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRIM1P49642 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRIM1P49642 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRIM1P49642 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRIM1P49642 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRIM1P49642 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRIM1P49642 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRIM1P49642 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRIM1P49642 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRIM1P49642 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRIM1P49642 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRIM1P49642 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRIM1P49642 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRIM1P49642 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRIM1P49642 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
PRIM1P49642 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRIM1P49642 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRIM1P49642 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRIM1P49642 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRIM1P49642 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRIM1P49642 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRIM1P49642 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRIM1P49642 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRIM1P49642 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRIM1P49642 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRIM1P49642 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRIM1P49642 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRIM1P49642 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRIM1P49642 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRIM1P49642 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRIM1P49642 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRIM1P49642 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRIM1P49642 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRIM1P49642 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRIM1P49642 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRIM1P49642 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRIM1P49642 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRIM1P49642 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRIM1P49642 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRIM1P49642 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRIM1P49642 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRIM1P49642 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRIM1P49642 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRIM1P49642 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRIM1P49642 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRIM1P49642 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
PRIM1P49642 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRIM1P49642 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRIM1P49642 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRIM1P49642 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRIM1P49642 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRIM1P49642 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
PRIM1P49642 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRIM1P49642 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRIM1P49642 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRIM1P49642 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRIM1P49642 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRIM1P49642 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRIM1P49642 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRIM1P49642 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRIM1P49642 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRIM1P49642 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRIM1P49642 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRIM1P49642 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRIM1P49642 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRIM1P49642 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRIM1P49642 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRIM1P49642 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRIM1P49642 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRIM1P49642 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRIM1P49642 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms