Protein–RNA interactions for Protein: P40818

USP8, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP8P40818 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
USP8P40818 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
USP8P40818 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC21.29■■□□□ 1
USP8P40818 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
USP8P40818 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC21.29■■□□□ 1
USP8P40818 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
USP8P40818 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
USP8P40818 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC21.29■■□□□ 1
USP8P40818 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
USP8P40818 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
USP8P40818 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
USP8P40818 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
USP8P40818 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
USP8P40818 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
USP8P40818 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
USP8P40818 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
USP8P40818 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
USP8P40818 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
USP8P40818 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
USP8P40818 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
USP8P40818 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
USP8P40818 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
USP8P40818 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
USP8P40818 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
USP8P40818 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
USP8P40818 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
USP8P40818 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
USP8P40818 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
USP8P40818 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
USP8P40818 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
USP8P40818 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
USP8P40818 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
USP8P40818 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
USP8P40818 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
USP8P40818 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
USP8P40818 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
USP8P40818 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
USP8P40818 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC21.27■■□□□ 1
USP8P40818 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
USP8P40818 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
USP8P40818 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
USP8P40818 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
USP8P40818 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
USP8P40818 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
USP8P40818 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
USP8P40818 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
USP8P40818 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
USP8P40818 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
USP8P40818 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
USP8P40818 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
USP8P40818 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
USP8P40818 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
USP8P40818 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
USP8P40818 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
USP8P40818 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
USP8P40818 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
USP8P40818 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
USP8P40818 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
USP8P40818 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
USP8P40818 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
USP8P40818 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
USP8P40818 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
USP8P40818 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
USP8P40818 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
USP8P40818 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
USP8P40818 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
USP8P40818 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
USP8P40818 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
USP8P40818 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
USP8P40818 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
USP8P40818 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
USP8P40818 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
USP8P40818 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
USP8P40818 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
USP8P40818 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
USP8P40818 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
USP8P40818 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
USP8P40818 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
USP8P40818 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
USP8P40818 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
USP8P40818 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
USP8P40818 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
USP8P40818 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
USP8P40818 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
USP8P40818 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
USP8P40818 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
USP8P40818 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
USP8P40818 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
USP8P40818 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
USP8P40818 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
USP8P40818 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
USP8P40818 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
USP8P40818 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
USP8P40818 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
USP8P40818 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
USP8P40818 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
USP8P40818 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
USP8P40818 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
USP8P40818 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
USP8P40818 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms