Protein–RNA interactions for Protein: P40198

CEACAM3, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 3, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEACAM3P40198 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CEACAM3P40198 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CEACAM3P40198 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CEACAM3P40198 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CEACAM3P40198 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CEACAM3P40198 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CEACAM3P40198 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CEACAM3P40198 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CEACAM3P40198 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CEACAM3P40198 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CEACAM3P40198 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CEACAM3P40198 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CEACAM3P40198 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CEACAM3P40198 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CEACAM3P40198 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CEACAM3P40198 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CEACAM3P40198 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CEACAM3P40198 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CEACAM3P40198 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CEACAM3P40198 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CEACAM3P40198 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CEACAM3P40198 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CEACAM3P40198 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CEACAM3P40198 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CEACAM3P40198 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CEACAM3P40198 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CEACAM3P40198 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CEACAM3P40198 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CEACAM3P40198 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CEACAM3P40198 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CEACAM3P40198 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CEACAM3P40198 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CEACAM3P40198 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CEACAM3P40198 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CEACAM3P40198 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CEACAM3P40198 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CEACAM3P40198 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CEACAM3P40198 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CEACAM3P40198 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CEACAM3P40198 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CEACAM3P40198 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CEACAM3P40198 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CEACAM3P40198 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CEACAM3P40198 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CEACAM3P40198 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CEACAM3P40198 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CEACAM3P40198 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CEACAM3P40198 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CEACAM3P40198 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CEACAM3P40198 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CEACAM3P40198 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CEACAM3P40198 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CEACAM3P40198 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CEACAM3P40198 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CEACAM3P40198 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CEACAM3P40198 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CEACAM3P40198 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CEACAM3P40198 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CEACAM3P40198 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CEACAM3P40198 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CEACAM3P40198 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CEACAM3P40198 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CEACAM3P40198 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CEACAM3P40198 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CEACAM3P40198 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CEACAM3P40198 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CEACAM3P40198 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CEACAM3P40198 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CEACAM3P40198 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CEACAM3P40198 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CEACAM3P40198 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CEACAM3P40198 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CEACAM3P40198 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CEACAM3P40198 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CEACAM3P40198 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CEACAM3P40198 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CEACAM3P40198 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CEACAM3P40198 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CEACAM3P40198 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CEACAM3P40198 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CEACAM3P40198 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CEACAM3P40198 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CEACAM3P40198 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CEACAM3P40198 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CEACAM3P40198 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CEACAM3P40198 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CEACAM3P40198 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CEACAM3P40198 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CEACAM3P40198 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CEACAM3P40198 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CEACAM3P40198 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CEACAM3P40198 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CEACAM3P40198 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CEACAM3P40198 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CEACAM3P40198 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CEACAM3P40198 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CEACAM3P40198 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CEACAM3P40198 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CEACAM3P40198 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CEACAM3P40198 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms