Protein–RNA interactions for Protein: P36954

POLR2I, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2IP36954 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
POLR2IP36954 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
POLR2IP36954 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
POLR2IP36954 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
POLR2IP36954 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
POLR2IP36954 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
POLR2IP36954 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
POLR2IP36954 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
POLR2IP36954 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
POLR2IP36954 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
POLR2IP36954 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
POLR2IP36954 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
POLR2IP36954 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
POLR2IP36954 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
POLR2IP36954 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
POLR2IP36954 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
POLR2IP36954 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
POLR2IP36954 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR2IP36954 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR2IP36954 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR2IP36954 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR2IP36954 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR2IP36954 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR2IP36954 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR2IP36954 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR2IP36954 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR2IP36954 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR2IP36954 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR2IP36954 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR2IP36954 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR2IP36954 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR2IP36954 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR2IP36954 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR2IP36954 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR2IP36954 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR2IP36954 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR2IP36954 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR2IP36954 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR2IP36954 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR2IP36954 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR2IP36954 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR2IP36954 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR2IP36954 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR2IP36954 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
POLR2IP36954 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
POLR2IP36954 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
POLR2IP36954 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
POLR2IP36954 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
POLR2IP36954 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
POLR2IP36954 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
POLR2IP36954 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
POLR2IP36954 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
POLR2IP36954 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
POLR2IP36954 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
POLR2IP36954 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
POLR2IP36954 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
POLR2IP36954 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
POLR2IP36954 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
POLR2IP36954 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
POLR2IP36954 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
POLR2IP36954 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
POLR2IP36954 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
POLR2IP36954 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
POLR2IP36954 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
POLR2IP36954 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
POLR2IP36954 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC18■□□□□ 0.47
POLR2IP36954 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
POLR2IP36954 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC18■□□□□ 0.47
POLR2IP36954 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
POLR2IP36954 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
POLR2IP36954 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
POLR2IP36954 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
POLR2IP36954 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
POLR2IP36954 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
POLR2IP36954 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC18■□□□□ 0.47
POLR2IP36954 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
POLR2IP36954 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
POLR2IP36954 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
POLR2IP36954 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
POLR2IP36954 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
POLR2IP36954 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
POLR2IP36954 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLR2IP36954 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLR2IP36954 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLR2IP36954 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLR2IP36954 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLR2IP36954 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLR2IP36954 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLR2IP36954 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
POLR2IP36954 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLR2IP36954 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLR2IP36954 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLR2IP36954 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLR2IP36954 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLR2IP36954 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
POLR2IP36954 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLR2IP36954 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLR2IP36954 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLR2IP36954 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
POLR2IP36954 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms