Protein–RNA interactions for Protein: P35609

ACTN2, Alpha-actinin-2, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN2P35609 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ACTN2P35609 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ACTN2P35609 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
ACTN2P35609 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ACTN2P35609 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ACTN2P35609 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ACTN2P35609 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ACTN2P35609 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ACTN2P35609 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ACTN2P35609 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ACTN2P35609 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ACTN2P35609 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ACTN2P35609 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ACTN2P35609 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ACTN2P35609 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ACTN2P35609 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ACTN2P35609 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ACTN2P35609 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ACTN2P35609 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ACTN2P35609 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ACTN2P35609 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ACTN2P35609 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ACTN2P35609 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ACTN2P35609 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ACTN2P35609 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ACTN2P35609 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ACTN2P35609 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
ACTN2P35609 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ACTN2P35609 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ACTN2P35609 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ACTN2P35609 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ACTN2P35609 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ACTN2P35609 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ACTN2P35609 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ACTN2P35609 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ACTN2P35609 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ACTN2P35609 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ACTN2P35609 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ACTN2P35609 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ACTN2P35609 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ACTN2P35609 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ACTN2P35609 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ACTN2P35609 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ACTN2P35609 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ACTN2P35609 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ACTN2P35609 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ACTN2P35609 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ACTN2P35609 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ACTN2P35609 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ACTN2P35609 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ACTN2P35609 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ACTN2P35609 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ACTN2P35609 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ACTN2P35609 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ACTN2P35609 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ACTN2P35609 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ACTN2P35609 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ACTN2P35609 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ACTN2P35609 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
ACTN2P35609 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ACTN2P35609 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ACTN2P35609 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ACTN2P35609 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ACTN2P35609 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ACTN2P35609 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ACTN2P35609 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ACTN2P35609 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ACTN2P35609 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ACTN2P35609 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ACTN2P35609 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ACTN2P35609 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ACTN2P35609 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ACTN2P35609 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
ACTN2P35609 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ACTN2P35609 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
ACTN2P35609 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ACTN2P35609 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ACTN2P35609 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ACTN2P35609 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ACTN2P35609 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ACTN2P35609 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ACTN2P35609 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ACTN2P35609 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ACTN2P35609 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
ACTN2P35609 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
ACTN2P35609 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ACTN2P35609 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ACTN2P35609 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ACTN2P35609 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ACTN2P35609 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ACTN2P35609 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ACTN2P35609 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ACTN2P35609 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ACTN2P35609 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ACTN2P35609 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ACTN2P35609 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ACTN2P35609 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ACTN2P35609 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ACTN2P35609 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ACTN2P35609 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms