Protein–RNA interactions for Protein: P32780

GTF2H1, General transcription factor IIH subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H1P32780 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GTF2H1P32780 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
GTF2H1P32780 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
GTF2H1P32780 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GTF2H1P32780 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GTF2H1P32780 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GTF2H1P32780 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GTF2H1P32780 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GTF2H1P32780 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GTF2H1P32780 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GTF2H1P32780 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
GTF2H1P32780 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GTF2H1P32780 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GTF2H1P32780 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GTF2H1P32780 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GTF2H1P32780 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GTF2H1P32780 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GTF2H1P32780 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GTF2H1P32780 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GTF2H1P32780 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GTF2H1P32780 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GTF2H1P32780 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GTF2H1P32780 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GTF2H1P32780 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GTF2H1P32780 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
GTF2H1P32780 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GTF2H1P32780 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GTF2H1P32780 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GTF2H1P32780 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GTF2H1P32780 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GTF2H1P32780 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GTF2H1P32780 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GTF2H1P32780 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GTF2H1P32780 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GTF2H1P32780 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GTF2H1P32780 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GTF2H1P32780 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GTF2H1P32780 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GTF2H1P32780 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GTF2H1P32780 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GTF2H1P32780 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GTF2H1P32780 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GTF2H1P32780 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GTF2H1P32780 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GTF2H1P32780 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GTF2H1P32780 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GTF2H1P32780 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GTF2H1P32780 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GTF2H1P32780 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GTF2H1P32780 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GTF2H1P32780 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GTF2H1P32780 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GTF2H1P32780 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GTF2H1P32780 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GTF2H1P32780 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GTF2H1P32780 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GTF2H1P32780 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GTF2H1P32780 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GTF2H1P32780 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GTF2H1P32780 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GTF2H1P32780 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GTF2H1P32780 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GTF2H1P32780 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GTF2H1P32780 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GTF2H1P32780 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GTF2H1P32780 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
GTF2H1P32780 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
GTF2H1P32780 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GTF2H1P32780 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GTF2H1P32780 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GTF2H1P32780 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GTF2H1P32780 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GTF2H1P32780 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GTF2H1P32780 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GTF2H1P32780 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GTF2H1P32780 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GTF2H1P32780 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GTF2H1P32780 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GTF2H1P32780 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GTF2H1P32780 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GTF2H1P32780 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GTF2H1P32780 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GTF2H1P32780 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GTF2H1P32780 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GTF2H1P32780 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GTF2H1P32780 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GTF2H1P32780 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GTF2H1P32780 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
GTF2H1P32780 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GTF2H1P32780 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GTF2H1P32780 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GTF2H1P32780 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GTF2H1P32780 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GTF2H1P32780 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GTF2H1P32780 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GTF2H1P32780 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GTF2H1P32780 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GTF2H1P32780 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GTF2H1P32780 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GTF2H1P32780 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.3 ms