Protein–RNA interactions for Protein: P32242

OTX1, Homeobox protein OTX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTX1P32242 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
OTX1P32242 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
OTX1P32242 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
OTX1P32242 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
OTX1P32242 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
OTX1P32242 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
OTX1P32242 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
OTX1P32242 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
OTX1P32242 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
OTX1P32242 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
OTX1P32242 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
OTX1P32242 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
OTX1P32242 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
OTX1P32242 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
OTX1P32242 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
OTX1P32242 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
OTX1P32242 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
OTX1P32242 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
OTX1P32242 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
OTX1P32242 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
OTX1P32242 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
OTX1P32242 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
OTX1P32242 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
OTX1P32242 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
OTX1P32242 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
OTX1P32242 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
OTX1P32242 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
OTX1P32242 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
OTX1P32242 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
OTX1P32242 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
OTX1P32242 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
OTX1P32242 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
OTX1P32242 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
OTX1P32242 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
OTX1P32242 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
OTX1P32242 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
OTX1P32242 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
OTX1P32242 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
OTX1P32242 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
OTX1P32242 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
OTX1P32242 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
OTX1P32242 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
OTX1P32242 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
OTX1P32242 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
OTX1P32242 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
OTX1P32242 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
OTX1P32242 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
OTX1P32242 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
OTX1P32242 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
OTX1P32242 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
OTX1P32242 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
OTX1P32242 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
OTX1P32242 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
OTX1P32242 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
OTX1P32242 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
OTX1P32242 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
OTX1P32242 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
OTX1P32242 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
OTX1P32242 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
OTX1P32242 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
OTX1P32242 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
OTX1P32242 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
OTX1P32242 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
OTX1P32242 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
OTX1P32242 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
OTX1P32242 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
OTX1P32242 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
OTX1P32242 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
OTX1P32242 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
OTX1P32242 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
OTX1P32242 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
OTX1P32242 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
OTX1P32242 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
OTX1P32242 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
OTX1P32242 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
OTX1P32242 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
OTX1P32242 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
OTX1P32242 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
OTX1P32242 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
OTX1P32242 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
OTX1P32242 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
OTX1P32242 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
OTX1P32242 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
OTX1P32242 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
OTX1P32242 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
OTX1P32242 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
OTX1P32242 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
OTX1P32242 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
OTX1P32242 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
OTX1P32242 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
OTX1P32242 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
OTX1P32242 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
OTX1P32242 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
OTX1P32242 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
OTX1P32242 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
OTX1P32242 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
OTX1P32242 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
OTX1P32242 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
OTX1P32242 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
OTX1P32242 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms