Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PTPRMP28827 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PTPRMP28827 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PTPRMP28827 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PTPRMP28827 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PTPRMP28827 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PTPRMP28827 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PTPRMP28827 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PTPRMP28827 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PTPRMP28827 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PTPRMP28827 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PTPRMP28827 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PTPRMP28827 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PTPRMP28827 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PTPRMP28827 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PTPRMP28827 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PTPRMP28827 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PTPRMP28827 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PTPRMP28827 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PTPRMP28827 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PTPRMP28827 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PTPRMP28827 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PTPRMP28827 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PTPRMP28827 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PTPRMP28827 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PTPRMP28827 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PTPRMP28827 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PTPRMP28827 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PTPRMP28827 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PTPRMP28827 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PTPRMP28827 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PTPRMP28827 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PTPRMP28827 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PTPRMP28827 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PTPRMP28827 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PTPRMP28827 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PTPRMP28827 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PTPRMP28827 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PTPRMP28827 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
PTPRMP28827 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PTPRMP28827 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PTPRMP28827 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
PTPRMP28827 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PTPRMP28827 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PTPRMP28827 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PTPRMP28827 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PTPRMP28827 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
PTPRMP28827 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PTPRMP28827 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PTPRMP28827 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PTPRMP28827 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PTPRMP28827 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PTPRMP28827 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PTPRMP28827 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PTPRMP28827 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PTPRMP28827 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PTPRMP28827 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PTPRMP28827 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PTPRMP28827 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PTPRMP28827 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PTPRMP28827 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PTPRMP28827 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PTPRMP28827 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PTPRMP28827 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PTPRMP28827 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PTPRMP28827 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
PTPRMP28827 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PTPRMP28827 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
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PTPRMP28827 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PTPRMP28827 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PTPRMP28827 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PTPRMP28827 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PTPRMP28827 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PTPRMP28827 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PTPRMP28827 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PTPRMP28827 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
PTPRMP28827 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PTPRMP28827 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PTPRMP28827 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PTPRMP28827 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
PTPRMP28827 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PTPRMP28827 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PTPRMP28827 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PTPRMP28827 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PTPRMP28827 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PTPRMP28827 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PTPRMP28827 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
PTPRMP28827 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PTPRMP28827 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PTPRMP28827 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PTPRMP28827 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
PTPRMP28827 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PTPRMP28827 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PTPRMP28827 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PTPRMP28827 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
PTPRMP28827 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PTPRMP28827 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
PTPRMP28827 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PTPRMP28827 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
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