Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HOXD10P28358 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXD10P28358 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXD10P28358 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXD10P28358 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXD10P28358 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXD10P28358 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXD10P28358 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXD10P28358 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXD10P28358 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXD10P28358 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXD10P28358 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXD10P28358 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXD10P28358 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXD10P28358 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXD10P28358 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXD10P28358 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXD10P28358 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXD10P28358 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXD10P28358 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXD10P28358 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXD10P28358 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXD10P28358 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXD10P28358 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXD10P28358 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXD10P28358 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXD10P28358 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXD10P28358 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXD10P28358 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXD10P28358 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXD10P28358 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXD10P28358 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXD10P28358 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXD10P28358 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXD10P28358 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXD10P28358 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXD10P28358 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXD10P28358 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXD10P28358 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXD10P28358 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXD10P28358 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXD10P28358 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXD10P28358 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXD10P28358 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXD10P28358 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXD10P28358 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXD10P28358 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXD10P28358 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXD10P28358 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXD10P28358 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXD10P28358 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXD10P28358 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXD10P28358 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXD10P28358 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXD10P28358 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXD10P28358 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXD10P28358 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXD10P28358 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXD10P28358 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXD10P28358 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXD10P28358 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXD10P28358 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXD10P28358 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXD10P28358 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXD10P28358 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXD10P28358 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXD10P28358 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXD10P28358 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXD10P28358 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXD10P28358 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXD10P28358 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXD10P28358 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXD10P28358 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXD10P28358 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXD10P28358 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXD10P28358 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXD10P28358 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXD10P28358 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXD10P28358 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXD10P28358 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXD10P28358 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXD10P28358 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXD10P28358 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXD10P28358 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXD10P28358 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXD10P28358 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXD10P28358 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXD10P28358 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXD10P28358 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXD10P28358 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXD10P28358 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXD10P28358 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXD10P28358 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXD10P28358 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXD10P28358 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXD10P28358 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXD10P28358 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXD10P28358 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXD10P28358 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXD10P28358 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms