Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPRBP23467 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPRBP23467 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPRBP23467 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPRBP23467 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPRBP23467 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPRBP23467 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPRBP23467 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPRBP23467 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPRBP23467 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPRBP23467 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPRBP23467 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPRBP23467 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPRBP23467 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPRBP23467 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPRBP23467 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPRBP23467 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPRBP23467 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPRBP23467 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPRBP23467 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPRBP23467 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPRBP23467 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPRBP23467 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPRBP23467 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPRBP23467 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPRBP23467 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPRBP23467 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPRBP23467 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPRBP23467 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPRBP23467 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPRBP23467 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPRBP23467 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPRBP23467 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPRBP23467 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PTPRBP23467 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PTPRBP23467 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRBP23467 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRBP23467 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRBP23467 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRBP23467 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRBP23467 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRBP23467 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRBP23467 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRBP23467 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRBP23467 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRBP23467 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRBP23467 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRBP23467 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRBP23467 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRBP23467 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRBP23467 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRBP23467 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRBP23467 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRBP23467 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRBP23467 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRBP23467 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRBP23467 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRBP23467 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRBP23467 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRBP23467 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPRBP23467 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPRBP23467 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPRBP23467 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPRBP23467 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPRBP23467 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPRBP23467 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPRBP23467 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPRBP23467 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPRBP23467 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPRBP23467 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPRBP23467 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPRBP23467 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPRBP23467 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPRBP23467 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPRBP23467 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPRBP23467 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPRBP23467 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRBP23467 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRBP23467 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRBP23467 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRBP23467 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRBP23467 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRBP23467 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRBP23467 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRBP23467 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRBP23467 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRBP23467 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRBP23467 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRBP23467 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRBP23467 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRBP23467 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRBP23467 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRBP23467 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRBP23467 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRBP23467 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRBP23467 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRBP23467 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRBP23467 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRBP23467 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPRBP23467 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
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