Protein–RNA interactions for Protein: P12980

LYL1, Protein lyl-1, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYL1P12980 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LYL1P12980 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LYL1P12980 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LYL1P12980 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LYL1P12980 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LYL1P12980 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LYL1P12980 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LYL1P12980 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LYL1P12980 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LYL1P12980 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LYL1P12980 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LYL1P12980 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LYL1P12980 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LYL1P12980 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LYL1P12980 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LYL1P12980 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LYL1P12980 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LYL1P12980 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LYL1P12980 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LYL1P12980 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LYL1P12980 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LYL1P12980 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LYL1P12980 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LYL1P12980 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
LYL1P12980 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LYL1P12980 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LYL1P12980 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
LYL1P12980 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LYL1P12980 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LYL1P12980 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LYL1P12980 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LYL1P12980 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LYL1P12980 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LYL1P12980 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LYL1P12980 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LYL1P12980 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LYL1P12980 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LYL1P12980 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LYL1P12980 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LYL1P12980 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LYL1P12980 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LYL1P12980 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LYL1P12980 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LYL1P12980 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LYL1P12980 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LYL1P12980 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LYL1P12980 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LYL1P12980 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LYL1P12980 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LYL1P12980 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LYL1P12980 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LYL1P12980 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LYL1P12980 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LYL1P12980 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LYL1P12980 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LYL1P12980 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LYL1P12980 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LYL1P12980 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
LYL1P12980 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LYL1P12980 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LYL1P12980 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LYL1P12980 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LYL1P12980 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LYL1P12980 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LYL1P12980 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LYL1P12980 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LYL1P12980 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LYL1P12980 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LYL1P12980 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LYL1P12980 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LYL1P12980 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LYL1P12980 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LYL1P12980 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LYL1P12980 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LYL1P12980 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LYL1P12980 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LYL1P12980 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LYL1P12980 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LYL1P12980 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LYL1P12980 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LYL1P12980 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LYL1P12980 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LYL1P12980 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LYL1P12980 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LYL1P12980 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LYL1P12980 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LYL1P12980 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LYL1P12980 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LYL1P12980 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LYL1P12980 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LYL1P12980 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LYL1P12980 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LYL1P12980 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LYL1P12980 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
LYL1P12980 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LYL1P12980 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LYL1P12980 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LYL1P12980 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LYL1P12980 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LYL1P12980 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms