Protein–RNA interactions for Protein: P12107

COL11A1, Collagen alpha-1(XI) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL11A1P12107 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COL11A1P12107 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COL11A1P12107 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COL11A1P12107 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COL11A1P12107 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COL11A1P12107 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COL11A1P12107 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COL11A1P12107 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COL11A1P12107 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COL11A1P12107 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COL11A1P12107 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COL11A1P12107 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COL11A1P12107 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COL11A1P12107 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COL11A1P12107 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COL11A1P12107 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
COL11A1P12107 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COL11A1P12107 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
COL11A1P12107 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
COL11A1P12107 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
COL11A1P12107 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
COL11A1P12107 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
COL11A1P12107 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COL11A1P12107 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
COL11A1P12107 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
COL11A1P12107 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COL11A1P12107 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COL11A1P12107 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COL11A1P12107 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
COL11A1P12107 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
COL11A1P12107 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
COL11A1P12107 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
COL11A1P12107 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
COL11A1P12107 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COL11A1P12107 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
COL11A1P12107 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
COL11A1P12107 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
COL11A1P12107 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
COL11A1P12107 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
COL11A1P12107 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
COL11A1P12107 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
COL11A1P12107 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
COL11A1P12107 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
COL11A1P12107 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
COL11A1P12107 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
COL11A1P12107 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
COL11A1P12107 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
COL11A1P12107 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
COL11A1P12107 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
COL11A1P12107 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
COL11A1P12107 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
COL11A1P12107 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.16
COL11A1P12107 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
COL11A1P12107 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
COL11A1P12107 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
COL11A1P12107 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
COL11A1P12107 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
COL11A1P12107 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
COL11A1P12107 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
COL11A1P12107 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COL11A1P12107 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COL11A1P12107 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COL11A1P12107 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
COL11A1P12107 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COL11A1P12107 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
COL11A1P12107 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
COL11A1P12107 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COL11A1P12107 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COL11A1P12107 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
COL11A1P12107 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COL11A1P12107 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COL11A1P12107 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
COL11A1P12107 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COL11A1P12107 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COL11A1P12107 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COL11A1P12107 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
COL11A1P12107 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
COL11A1P12107 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
COL11A1P12107 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
COL11A1P12107 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
COL11A1P12107 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COL11A1P12107 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
COL11A1P12107 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COL11A1P12107 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COL11A1P12107 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
COL11A1P12107 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COL11A1P12107 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
COL11A1P12107 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
COL11A1P12107 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
COL11A1P12107 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
COL11A1P12107 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
COL11A1P12107 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
COL11A1P12107 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
COL11A1P12107 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
COL11A1P12107 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
COL11A1P12107 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
COL11A1P12107 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COL11A1P12107 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COL11A1P12107 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COL11A1P12107 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms