Protein–RNA interactions for Protein: P10075

GLI4, Zinc finger protein GLI4, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI4P10075 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GLI4P10075 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
GLI4P10075 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
GLI4P10075 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GLI4P10075 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GLI4P10075 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GLI4P10075 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GLI4P10075 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GLI4P10075 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GLI4P10075 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GLI4P10075 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GLI4P10075 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
GLI4P10075 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GLI4P10075 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GLI4P10075 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
GLI4P10075 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GLI4P10075 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GLI4P10075 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GLI4P10075 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GLI4P10075 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GLI4P10075 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GLI4P10075 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GLI4P10075 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
GLI4P10075 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GLI4P10075 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GLI4P10075 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GLI4P10075 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GLI4P10075 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GLI4P10075 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GLI4P10075 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GLI4P10075 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GLI4P10075 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GLI4P10075 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GLI4P10075 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GLI4P10075 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GLI4P10075 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GLI4P10075 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GLI4P10075 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GLI4P10075 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GLI4P10075 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GLI4P10075 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GLI4P10075 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GLI4P10075 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GLI4P10075 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GLI4P10075 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GLI4P10075 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GLI4P10075 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GLI4P10075 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GLI4P10075 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GLI4P10075 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GLI4P10075 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GLI4P10075 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GLI4P10075 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
GLI4P10075 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
GLI4P10075 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GLI4P10075 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GLI4P10075 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GLI4P10075 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GLI4P10075 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GLI4P10075 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GLI4P10075 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
GLI4P10075 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GLI4P10075 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GLI4P10075 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GLI4P10075 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GLI4P10075 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GLI4P10075 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GLI4P10075 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GLI4P10075 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
GLI4P10075 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GLI4P10075 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GLI4P10075 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GLI4P10075 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
GLI4P10075 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GLI4P10075 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GLI4P10075 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GLI4P10075 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GLI4P10075 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GLI4P10075 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GLI4P10075 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GLI4P10075 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GLI4P10075 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GLI4P10075 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GLI4P10075 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GLI4P10075 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
GLI4P10075 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GLI4P10075 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GLI4P10075 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GLI4P10075 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GLI4P10075 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GLI4P10075 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GLI4P10075 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GLI4P10075 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GLI4P10075 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GLI4P10075 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GLI4P10075 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GLI4P10075 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GLI4P10075 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GLI4P10075 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GLI4P10075 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms