Protein–RNA interactions for Protein: P0DJI9

SAA2, Serum amyloid A-2 protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAA2P0DJI9 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SAA2P0DJI9 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SAA2P0DJI9 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SAA2P0DJI9 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SAA2P0DJI9 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SAA2P0DJI9 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SAA2P0DJI9 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SAA2P0DJI9 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SAA2P0DJI9 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SAA2P0DJI9 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SAA2P0DJI9 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SAA2P0DJI9 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SAA2P0DJI9 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SAA2P0DJI9 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SAA2P0DJI9 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SAA2P0DJI9 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SAA2P0DJI9 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SAA2P0DJI9 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SAA2P0DJI9 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SAA2P0DJI9 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SAA2P0DJI9 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SAA2P0DJI9 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SAA2P0DJI9 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SAA2P0DJI9 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SAA2P0DJI9 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SAA2P0DJI9 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SAA2P0DJI9 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SAA2P0DJI9 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SAA2P0DJI9 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SAA2P0DJI9 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SAA2P0DJI9 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SAA2P0DJI9 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SAA2P0DJI9 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SAA2P0DJI9 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SAA2P0DJI9 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SAA2P0DJI9 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SAA2P0DJI9 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SAA2P0DJI9 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SAA2P0DJI9 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SAA2P0DJI9 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SAA2P0DJI9 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SAA2P0DJI9 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SAA2P0DJI9 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SAA2P0DJI9 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SAA2P0DJI9 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SAA2P0DJI9 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SAA2P0DJI9 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SAA2P0DJI9 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SAA2P0DJI9 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SAA2P0DJI9 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SAA2P0DJI9 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SAA2P0DJI9 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SAA2P0DJI9 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SAA2P0DJI9 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SAA2P0DJI9 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SAA2P0DJI9 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SAA2P0DJI9 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SAA2P0DJI9 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SAA2P0DJI9 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SAA2P0DJI9 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SAA2P0DJI9 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SAA2P0DJI9 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SAA2P0DJI9 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SAA2P0DJI9 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SAA2P0DJI9 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SAA2P0DJI9 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SAA2P0DJI9 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SAA2P0DJI9 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SAA2P0DJI9 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SAA2P0DJI9 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SAA2P0DJI9 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SAA2P0DJI9 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SAA2P0DJI9 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SAA2P0DJI9 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SAA2P0DJI9 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SAA2P0DJI9 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SAA2P0DJI9 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SAA2P0DJI9 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SAA2P0DJI9 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SAA2P0DJI9 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SAA2P0DJI9 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SAA2P0DJI9 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SAA2P0DJI9 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SAA2P0DJI9 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SAA2P0DJI9 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SAA2P0DJI9 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SAA2P0DJI9 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SAA2P0DJI9 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SAA2P0DJI9 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SAA2P0DJI9 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SAA2P0DJI9 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SAA2P0DJI9 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SAA2P0DJI9 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SAA2P0DJI9 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SAA2P0DJI9 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SAA2P0DJI9 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SAA2P0DJI9 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SAA2P0DJI9 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SAA2P0DJI9 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SAA2P0DJI9 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms