Protein–RNA interactions for Protein: P07197

NEFM, Neurofilament medium polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFMP07197 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NEFMP07197 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NEFMP07197 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NEFMP07197 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NEFMP07197 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NEFMP07197 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NEFMP07197 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NEFMP07197 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NEFMP07197 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NEFMP07197 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NEFMP07197 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NEFMP07197 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
NEFMP07197 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NEFMP07197 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NEFMP07197 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NEFMP07197 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NEFMP07197 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
NEFMP07197 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NEFMP07197 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NEFMP07197 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NEFMP07197 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NEFMP07197 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NEFMP07197 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NEFMP07197 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NEFMP07197 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NEFMP07197 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NEFMP07197 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NEFMP07197 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NEFMP07197 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
NEFMP07197 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NEFMP07197 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NEFMP07197 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NEFMP07197 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NEFMP07197 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NEFMP07197 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NEFMP07197 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NEFMP07197 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NEFMP07197 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NEFMP07197 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NEFMP07197 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NEFMP07197 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NEFMP07197 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NEFMP07197 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NEFMP07197 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NEFMP07197 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NEFMP07197 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NEFMP07197 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NEFMP07197 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NEFMP07197 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NEFMP07197 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NEFMP07197 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NEFMP07197 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NEFMP07197 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NEFMP07197 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NEFMP07197 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NEFMP07197 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NEFMP07197 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NEFMP07197 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NEFMP07197 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NEFMP07197 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NEFMP07197 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NEFMP07197 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NEFMP07197 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NEFMP07197 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NEFMP07197 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NEFMP07197 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NEFMP07197 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NEFMP07197 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NEFMP07197 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NEFMP07197 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NEFMP07197 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NEFMP07197 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NEFMP07197 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NEFMP07197 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NEFMP07197 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NEFMP07197 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NEFMP07197 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NEFMP07197 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NEFMP07197 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NEFMP07197 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NEFMP07197 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NEFMP07197 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NEFMP07197 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NEFMP07197 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NEFMP07197 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NEFMP07197 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NEFMP07197 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NEFMP07197 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NEFMP07197 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NEFMP07197 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
NEFMP07197 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NEFMP07197 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NEFMP07197 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NEFMP07197 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NEFMP07197 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
NEFMP07197 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
NEFMP07197 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NEFMP07197 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NEFMP07197 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NEFMP07197 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms