Protein–RNA interactions for Protein: P04198

MYCN, N-myc proto-oncogene protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYCNP04198 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MYCNP04198 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MYCNP04198 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MYCNP04198 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MYCNP04198 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MYCNP04198 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MYCNP04198 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MYCNP04198 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MYCNP04198 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MYCNP04198 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MYCNP04198 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MYCNP04198 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MYCNP04198 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MYCNP04198 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MYCNP04198 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MYCNP04198 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MYCNP04198 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MYCNP04198 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MYCNP04198 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MYCNP04198 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MYCNP04198 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MYCNP04198 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MYCNP04198 AC010978.1-202ENST00000427050 893 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MYCNP04198 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MYCNP04198 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
MYCNP04198 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MYCNP04198 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MYCNP04198 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MYCNP04198 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MYCNP04198 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MYCNP04198 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MYCNP04198 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MYCNP04198 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MYCNP04198 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MYCNP04198 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MYCNP04198 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MYCNP04198 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MYCNP04198 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MYCNP04198 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MYCNP04198 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MYCNP04198 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MYCNP04198 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MYCNP04198 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MYCNP04198 AC005529.1-201ENST00000411969 289 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MYCNP04198 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MYCNP04198 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MYCNP04198 TCEANC-205ENST00000544987 1146 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MYCNP04198 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
MYCNP04198 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MYCNP04198 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MYCNP04198 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MYCNP04198 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MYCNP04198 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MYCNP04198 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MYCNP04198 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MYCNP04198 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MYCNP04198 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MYCNP04198 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MYCNP04198 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MYCNP04198 AC027701.1-202ENST00000520988 459 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MYCNP04198 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MYCNP04198 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MYCNP04198 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
MYCNP04198 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MYCNP04198 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
MYCNP04198 AL157762.1-201ENST00000619612 415 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
MYCNP04198 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MYCNP04198 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MYCNP04198 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
MYCNP04198 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MYCNP04198 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
MYCNP04198 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MYCNP04198 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MYCNP04198 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MYCNP04198 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MYCNP04198 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MYCNP04198 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MYCNP04198 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MYCNP04198 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MYCNP04198 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MYCNP04198 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MYCNP04198 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MYCNP04198 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MYCNP04198 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MYCNP04198 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MYCNP04198 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MYCNP04198 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MYCNP04198 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MYCNP04198 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MYCNP04198 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MYCNP04198 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MYCNP04198 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MYCNP04198 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MYCNP04198 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MYCNP04198 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MYCNP04198 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MYCNP04198 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MYCNP04198 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MYCNP04198 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MYCNP04198 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms