Protein–RNA interactions for Protein: P01861

IGHG4, Immunoglobulin heavy constant gamma 4, humanhuman

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHG4P01861 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IGHG4P01861 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IGHG4P01861 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IGHG4P01861 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IGHG4P01861 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IGHG4P01861 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IGHG4P01861 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IGHG4P01861 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
IGHG4P01861 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IGHG4P01861 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IGHG4P01861 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IGHG4P01861 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IGHG4P01861 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IGHG4P01861 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
IGHG4P01861 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
IGHG4P01861 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IGHG4P01861 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IGHG4P01861 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IGHG4P01861 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IGHG4P01861 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IGHG4P01861 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IGHG4P01861 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IGHG4P01861 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IGHG4P01861 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IGHG4P01861 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IGHG4P01861 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
IGHG4P01861 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
IGHG4P01861 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
IGHG4P01861 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IGHG4P01861 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IGHG4P01861 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IGHG4P01861 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IGHG4P01861 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IGHG4P01861 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
IGHG4P01861 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IGHG4P01861 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IGHG4P01861 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IGHG4P01861 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IGHG4P01861 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IGHG4P01861 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IGHG4P01861 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IGHG4P01861 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IGHG4P01861 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IGHG4P01861 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IGHG4P01861 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IGHG4P01861 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IGHG4P01861 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IGHG4P01861 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IGHG4P01861 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IGHG4P01861 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
IGHG4P01861 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IGHG4P01861 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IGHG4P01861 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IGHG4P01861 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IGHG4P01861 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IGHG4P01861 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IGHG4P01861 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IGHG4P01861 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
IGHG4P01861 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IGHG4P01861 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IGHG4P01861 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IGHG4P01861 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IGHG4P01861 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IGHG4P01861 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IGHG4P01861 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IGHG4P01861 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IGHG4P01861 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IGHG4P01861 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IGHG4P01861 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IGHG4P01861 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IGHG4P01861 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IGHG4P01861 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IGHG4P01861 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IGHG4P01861 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IGHG4P01861 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGHG4P01861 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGHG4P01861 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGHG4P01861 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGHG4P01861 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGHG4P01861 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
IGHG4P01861 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGHG4P01861 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGHG4P01861 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGHG4P01861 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGHG4P01861 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGHG4P01861 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGHG4P01861 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGHG4P01861 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGHG4P01861 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGHG4P01861 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGHG4P01861 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGHG4P01861 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGHG4P01861 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGHG4P01861 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGHG4P01861 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGHG4P01861 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGHG4P01861 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGHG4P01861 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGHG4P01861 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGHG4P01861 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms