Protein–RNA interactions for Protein: O95347

SMC2, Structural maintenance of chromosomes protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC2O95347 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMC2O95347 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMC2O95347 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMC2O95347 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMC2O95347 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMC2O95347 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMC2O95347 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SMC2O95347 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMC2O95347 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMC2O95347 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMC2O95347 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMC2O95347 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMC2O95347 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMC2O95347 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMC2O95347 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMC2O95347 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMC2O95347 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMC2O95347 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMC2O95347 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMC2O95347 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMC2O95347 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMC2O95347 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMC2O95347 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMC2O95347 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMC2O95347 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMC2O95347 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMC2O95347 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMC2O95347 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMC2O95347 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMC2O95347 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMC2O95347 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMC2O95347 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMC2O95347 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SMC2O95347 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMC2O95347 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMC2O95347 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMC2O95347 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SMC2O95347 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMC2O95347 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMC2O95347 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMC2O95347 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMC2O95347 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMC2O95347 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMC2O95347 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMC2O95347 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMC2O95347 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMC2O95347 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMC2O95347 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMC2O95347 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMC2O95347 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMC2O95347 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMC2O95347 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMC2O95347 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMC2O95347 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMC2O95347 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMC2O95347 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMC2O95347 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMC2O95347 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMC2O95347 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMC2O95347 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMC2O95347 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMC2O95347 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMC2O95347 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMC2O95347 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SMC2O95347 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SMC2O95347 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SMC2O95347 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SMC2O95347 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SMC2O95347 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SMC2O95347 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SMC2O95347 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMC2O95347 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMC2O95347 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMC2O95347 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMC2O95347 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMC2O95347 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMC2O95347 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SMC2O95347 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMC2O95347 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMC2O95347 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMC2O95347 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMC2O95347 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMC2O95347 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMC2O95347 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMC2O95347 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMC2O95347 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMC2O95347 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMC2O95347 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMC2O95347 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMC2O95347 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMC2O95347 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMC2O95347 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMC2O95347 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMC2O95347 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMC2O95347 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMC2O95347 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMC2O95347 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMC2O95347 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMC2O95347 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMC2O95347 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.6 ms