Protein–RNA interactions for Protein: O76039

CDKL5, Cyclin-dependent kinase-like 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,030 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL5O76039 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDKL5O76039 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDKL5O76039 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDKL5O76039 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDKL5O76039 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDKL5O76039 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDKL5O76039 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDKL5O76039 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDKL5O76039 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDKL5O76039 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDKL5O76039 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDKL5O76039 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDKL5O76039 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDKL5O76039 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDKL5O76039 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDKL5O76039 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDKL5O76039 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDKL5O76039 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDKL5O76039 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDKL5O76039 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDKL5O76039 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CDKL5O76039 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CDKL5O76039 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDKL5O76039 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDKL5O76039 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDKL5O76039 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDKL5O76039 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CDKL5O76039 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDKL5O76039 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDKL5O76039 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDKL5O76039 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDKL5O76039 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDKL5O76039 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDKL5O76039 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDKL5O76039 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDKL5O76039 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDKL5O76039 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDKL5O76039 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDKL5O76039 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDKL5O76039 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDKL5O76039 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDKL5O76039 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDKL5O76039 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDKL5O76039 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDKL5O76039 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CDKL5O76039 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDKL5O76039 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDKL5O76039 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDKL5O76039 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDKL5O76039 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDKL5O76039 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDKL5O76039 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
CDKL5O76039 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
CDKL5O76039 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDKL5O76039 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDKL5O76039 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDKL5O76039 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDKL5O76039 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDKL5O76039 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDKL5O76039 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDKL5O76039 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDKL5O76039 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDKL5O76039 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDKL5O76039 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDKL5O76039 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDKL5O76039 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDKL5O76039 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDKL5O76039 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CDKL5O76039 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDKL5O76039 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDKL5O76039 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDKL5O76039 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDKL5O76039 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDKL5O76039 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDKL5O76039 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDKL5O76039 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDKL5O76039 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDKL5O76039 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDKL5O76039 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDKL5O76039 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDKL5O76039 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDKL5O76039 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDKL5O76039 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDKL5O76039 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDKL5O76039 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CDKL5O76039 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDKL5O76039 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDKL5O76039 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDKL5O76039 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDKL5O76039 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDKL5O76039 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDKL5O76039 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDKL5O76039 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDKL5O76039 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDKL5O76039 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDKL5O76039 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDKL5O76039 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDKL5O76039 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDKL5O76039 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CDKL5O76039 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms