Protein–RNA interactions for Protein: O75461

E2F6, Transcription factor E2F6, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F6O75461 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
E2F6O75461 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
E2F6O75461 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
E2F6O75461 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
E2F6O75461 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
E2F6O75461 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
E2F6O75461 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
E2F6O75461 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
E2F6O75461 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
E2F6O75461 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
E2F6O75461 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
E2F6O75461 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
E2F6O75461 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
E2F6O75461 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
E2F6O75461 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
E2F6O75461 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
E2F6O75461 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
E2F6O75461 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
E2F6O75461 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
E2F6O75461 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
E2F6O75461 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
E2F6O75461 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
E2F6O75461 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
E2F6O75461 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
E2F6O75461 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
E2F6O75461 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
E2F6O75461 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
E2F6O75461 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
E2F6O75461 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
E2F6O75461 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
E2F6O75461 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
E2F6O75461 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
E2F6O75461 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
E2F6O75461 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
E2F6O75461 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
E2F6O75461 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
E2F6O75461 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
E2F6O75461 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
E2F6O75461 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
E2F6O75461 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
E2F6O75461 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
E2F6O75461 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
E2F6O75461 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
E2F6O75461 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
E2F6O75461 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
E2F6O75461 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
E2F6O75461 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
E2F6O75461 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
E2F6O75461 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
E2F6O75461 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
E2F6O75461 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
E2F6O75461 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
E2F6O75461 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
E2F6O75461 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
E2F6O75461 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
E2F6O75461 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
E2F6O75461 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
E2F6O75461 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
E2F6O75461 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
E2F6O75461 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
E2F6O75461 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
E2F6O75461 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
E2F6O75461 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
E2F6O75461 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
E2F6O75461 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
E2F6O75461 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
E2F6O75461 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
E2F6O75461 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
E2F6O75461 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
E2F6O75461 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
E2F6O75461 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
E2F6O75461 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
E2F6O75461 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
E2F6O75461 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
E2F6O75461 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
E2F6O75461 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
E2F6O75461 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
E2F6O75461 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
E2F6O75461 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
E2F6O75461 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
E2F6O75461 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
E2F6O75461 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
E2F6O75461 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
E2F6O75461 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
E2F6O75461 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
E2F6O75461 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
E2F6O75461 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
E2F6O75461 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
E2F6O75461 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
E2F6O75461 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
E2F6O75461 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
E2F6O75461 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
E2F6O75461 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
E2F6O75461 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
E2F6O75461 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
E2F6O75461 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
E2F6O75461 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
E2F6O75461 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
E2F6O75461 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
E2F6O75461 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms