Protein–RNA interactions for Protein: O75161

NPHP4, Nephrocystin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHP4O75161 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NPHP4O75161 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NPHP4O75161 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NPHP4O75161 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NPHP4O75161 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NPHP4O75161 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NPHP4O75161 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NPHP4O75161 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NPHP4O75161 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NPHP4O75161 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NPHP4O75161 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NPHP4O75161 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NPHP4O75161 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NPHP4O75161 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NPHP4O75161 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NPHP4O75161 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NPHP4O75161 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NPHP4O75161 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NPHP4O75161 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
NPHP4O75161 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NPHP4O75161 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
NPHP4O75161 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
NPHP4O75161 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
NPHP4O75161 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
NPHP4O75161 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
NPHP4O75161 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC27.7■■■□□ 2.03
NPHP4O75161 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
NPHP4O75161 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
NPHP4O75161 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
NPHP4O75161 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
NPHP4O75161 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
NPHP4O75161 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
NPHP4O75161 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
NPHP4O75161 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
NPHP4O75161 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
NPHP4O75161 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
NPHP4O75161 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
NPHP4O75161 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
NPHP4O75161 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
NPHP4O75161 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NPHP4O75161 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NPHP4O75161 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NPHP4O75161 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NPHP4O75161 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NPHP4O75161 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NPHP4O75161 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NPHP4O75161 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NPHP4O75161 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NPHP4O75161 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NPHP4O75161 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NPHP4O75161 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
NPHP4O75161 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NPHP4O75161 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NPHP4O75161 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NPHP4O75161 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
NPHP4O75161 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NPHP4O75161 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NPHP4O75161 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NPHP4O75161 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
NPHP4O75161 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NPHP4O75161 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NPHP4O75161 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NPHP4O75161 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NPHP4O75161 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NPHP4O75161 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NPHP4O75161 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NPHP4O75161 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NPHP4O75161 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NPHP4O75161 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
NPHP4O75161 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NPHP4O75161 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NPHP4O75161 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NPHP4O75161 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
NPHP4O75161 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NPHP4O75161 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NPHP4O75161 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NPHP4O75161 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NPHP4O75161 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NPHP4O75161 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
NPHP4O75161 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NPHP4O75161 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NPHP4O75161 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NPHP4O75161 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NPHP4O75161 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
NPHP4O75161 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
NPHP4O75161 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
NPHP4O75161 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NPHP4O75161 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NPHP4O75161 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NPHP4O75161 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
NPHP4O75161 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NPHP4O75161 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NPHP4O75161 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NPHP4O75161 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NPHP4O75161 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NPHP4O75161 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NPHP4O75161 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
NPHP4O75161 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NPHP4O75161 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NPHP4O75161 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms