Protein–RNA interactions for Protein: O60682

MSC, Musculin, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSCO60682 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MSCO60682 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MSCO60682 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MSCO60682 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MSCO60682 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MSCO60682 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MSCO60682 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
MSCO60682 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
MSCO60682 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
MSCO60682 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MSCO60682 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MSCO60682 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MSCO60682 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MSCO60682 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MSCO60682 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MSCO60682 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MSCO60682 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MSCO60682 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MSCO60682 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MSCO60682 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MSCO60682 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MSCO60682 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MSCO60682 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
MSCO60682 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MSCO60682 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MSCO60682 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MSCO60682 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MSCO60682 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MSCO60682 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MSCO60682 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MSCO60682 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MSCO60682 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
MSCO60682 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MSCO60682 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MSCO60682 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MSCO60682 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MSCO60682 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MSCO60682 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
MSCO60682 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MSCO60682 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MSCO60682 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MSCO60682 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MSCO60682 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MSCO60682 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MSCO60682 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MSCO60682 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MSCO60682 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MSCO60682 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MSCO60682 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MSCO60682 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MSCO60682 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MSCO60682 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
MSCO60682 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MSCO60682 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MSCO60682 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MSCO60682 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MSCO60682 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MSCO60682 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MSCO60682 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MSCO60682 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MSCO60682 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MSCO60682 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MSCO60682 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MSCO60682 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MSCO60682 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
MSCO60682 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MSCO60682 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MSCO60682 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MSCO60682 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MSCO60682 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MSCO60682 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MSCO60682 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
MSCO60682 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
MSCO60682 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MSCO60682 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MSCO60682 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MSCO60682 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MSCO60682 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MSCO60682 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MSCO60682 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MSCO60682 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MSCO60682 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MSCO60682 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MSCO60682 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MSCO60682 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MSCO60682 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MSCO60682 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
MSCO60682 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MSCO60682 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
MSCO60682 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MSCO60682 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
MSCO60682 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MSCO60682 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MSCO60682 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MSCO60682 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MSCO60682 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MSCO60682 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MSCO60682 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MSCO60682 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
MSCO60682 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms