Protein–RNA interactions for Protein: O60337

MARCH6, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH6, humanhuman

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCH6O60337 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MARCH6O60337 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MARCH6O60337 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MARCH6O60337 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MARCH6O60337 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MARCH6O60337 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MARCH6O60337 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MARCH6O60337 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MARCH6O60337 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MARCH6O60337 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MARCH6O60337 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MARCH6O60337 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MARCH6O60337 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MARCH6O60337 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MARCH6O60337 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MARCH6O60337 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MARCH6O60337 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MARCH6O60337 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MARCH6O60337 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MARCH6O60337 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MARCH6O60337 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MARCH6O60337 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MARCH6O60337 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MARCH6O60337 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MARCH6O60337 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MARCH6O60337 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MARCH6O60337 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MARCH6O60337 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
MARCH6O60337 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
MARCH6O60337 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MARCH6O60337 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
MARCH6O60337 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
MARCH6O60337 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MARCH6O60337 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MARCH6O60337 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MARCH6O60337 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MARCH6O60337 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
MARCH6O60337 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MARCH6O60337 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
MARCH6O60337 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
MARCH6O60337 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MARCH6O60337 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MARCH6O60337 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MARCH6O60337 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MARCH6O60337 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MARCH6O60337 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MARCH6O60337 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MARCH6O60337 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
MARCH6O60337 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MARCH6O60337 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MARCH6O60337 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MARCH6O60337 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MARCH6O60337 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MARCH6O60337 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MARCH6O60337 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MARCH6O60337 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MARCH6O60337 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MARCH6O60337 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
MARCH6O60337 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MARCH6O60337 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MARCH6O60337 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MARCH6O60337 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MARCH6O60337 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MARCH6O60337 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MARCH6O60337 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
MARCH6O60337 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MARCH6O60337 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MARCH6O60337 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MARCH6O60337 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MARCH6O60337 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MARCH6O60337 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MARCH6O60337 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MARCH6O60337 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MARCH6O60337 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MARCH6O60337 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MARCH6O60337 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MARCH6O60337 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
MARCH6O60337 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MARCH6O60337 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MARCH6O60337 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MARCH6O60337 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MARCH6O60337 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MARCH6O60337 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MARCH6O60337 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MARCH6O60337 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MARCH6O60337 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MARCH6O60337 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MARCH6O60337 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MARCH6O60337 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MARCH6O60337 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MARCH6O60337 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MARCH6O60337 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MARCH6O60337 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MARCH6O60337 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MARCH6O60337 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MARCH6O60337 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MARCH6O60337 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MARCH6O60337 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MARCH6O60337 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MARCH6O60337 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms