Protein–RNA interactions for Protein: O60231

DHX16, Putative pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase DHX16, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,041 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX16O60231 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DHX16O60231 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
DHX16O60231 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DHX16O60231 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DHX16O60231 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DHX16O60231 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DHX16O60231 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DHX16O60231 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DHX16O60231 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DHX16O60231 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DHX16O60231 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DHX16O60231 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DHX16O60231 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DHX16O60231 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DHX16O60231 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DHX16O60231 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DHX16O60231 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DHX16O60231 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DHX16O60231 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DHX16O60231 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DHX16O60231 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DHX16O60231 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
DHX16O60231 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DHX16O60231 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
DHX16O60231 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DHX16O60231 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DHX16O60231 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DHX16O60231 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
DHX16O60231 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DHX16O60231 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DHX16O60231 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DHX16O60231 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DHX16O60231 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DHX16O60231 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DHX16O60231 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DHX16O60231 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DHX16O60231 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DHX16O60231 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DHX16O60231 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DHX16O60231 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DHX16O60231 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DHX16O60231 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DHX16O60231 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DHX16O60231 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DHX16O60231 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DHX16O60231 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DHX16O60231 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DHX16O60231 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DHX16O60231 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DHX16O60231 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DHX16O60231 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DHX16O60231 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DHX16O60231 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DHX16O60231 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DHX16O60231 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DHX16O60231 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DHX16O60231 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DHX16O60231 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DHX16O60231 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DHX16O60231 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DHX16O60231 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DHX16O60231 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DHX16O60231 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DHX16O60231 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DHX16O60231 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DHX16O60231 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DHX16O60231 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DHX16O60231 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DHX16O60231 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DHX16O60231 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DHX16O60231 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DHX16O60231 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DHX16O60231 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DHX16O60231 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DHX16O60231 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DHX16O60231 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DHX16O60231 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DHX16O60231 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DHX16O60231 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DHX16O60231 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DHX16O60231 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DHX16O60231 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DHX16O60231 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DHX16O60231 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DHX16O60231 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DHX16O60231 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DHX16O60231 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DHX16O60231 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DHX16O60231 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DHX16O60231 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DHX16O60231 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DHX16O60231 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DHX16O60231 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DHX16O60231 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DHX16O60231 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
DHX16O60231 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DHX16O60231 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DHX16O60231 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DHX16O60231 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DHX16O60231 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms