Protein–RNA interactions for Protein: O43760

SYNGR2, Synaptogyrin-2, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR2O43760 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SYNGR2O43760 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SYNGR2O43760 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SYNGR2O43760 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SYNGR2O43760 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SYNGR2O43760 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SYNGR2O43760 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SYNGR2O43760 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SYNGR2O43760 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SYNGR2O43760 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SYNGR2O43760 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SYNGR2O43760 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SYNGR2O43760 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SYNGR2O43760 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SYNGR2O43760 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SYNGR2O43760 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SYNGR2O43760 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SYNGR2O43760 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SYNGR2O43760 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SYNGR2O43760 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SYNGR2O43760 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SYNGR2O43760 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SYNGR2O43760 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SYNGR2O43760 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SYNGR2O43760 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SYNGR2O43760 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SYNGR2O43760 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SYNGR2O43760 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SYNGR2O43760 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SYNGR2O43760 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SYNGR2O43760 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SYNGR2O43760 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SYNGR2O43760 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SYNGR2O43760 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SYNGR2O43760 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SYNGR2O43760 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SYNGR2O43760 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SYNGR2O43760 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SYNGR2O43760 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SYNGR2O43760 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SYNGR2O43760 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SYNGR2O43760 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SYNGR2O43760 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SYNGR2O43760 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SYNGR2O43760 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SYNGR2O43760 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SYNGR2O43760 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SYNGR2O43760 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SYNGR2O43760 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SYNGR2O43760 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SYNGR2O43760 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SYNGR2O43760 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SYNGR2O43760 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SYNGR2O43760 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SYNGR2O43760 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SYNGR2O43760 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SYNGR2O43760 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SYNGR2O43760 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SYNGR2O43760 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
SYNGR2O43760 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SYNGR2O43760 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SYNGR2O43760 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SYNGR2O43760 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SYNGR2O43760 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SYNGR2O43760 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SYNGR2O43760 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SYNGR2O43760 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SYNGR2O43760 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SYNGR2O43760 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SYNGR2O43760 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SYNGR2O43760 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SYNGR2O43760 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SYNGR2O43760 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SYNGR2O43760 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SYNGR2O43760 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SYNGR2O43760 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SYNGR2O43760 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SYNGR2O43760 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SYNGR2O43760 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SYNGR2O43760 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SYNGR2O43760 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SYNGR2O43760 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SYNGR2O43760 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SYNGR2O43760 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SYNGR2O43760 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SYNGR2O43760 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SYNGR2O43760 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SYNGR2O43760 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SYNGR2O43760 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SYNGR2O43760 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SYNGR2O43760 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SYNGR2O43760 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SYNGR2O43760 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SYNGR2O43760 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SYNGR2O43760 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SYNGR2O43760 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SYNGR2O43760 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SYNGR2O43760 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SYNGR2O43760 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SYNGR2O43760 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms