Protein–RNA interactions for Protein: O43295

SRGAP3, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,099 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRGAP3O43295 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SRGAP3O43295 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SRGAP3O43295 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SRGAP3O43295 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SRGAP3O43295 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SRGAP3O43295 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SRGAP3O43295 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SRGAP3O43295 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SRGAP3O43295 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SRGAP3O43295 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SRGAP3O43295 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SRGAP3O43295 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SRGAP3O43295 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SRGAP3O43295 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SRGAP3O43295 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SRGAP3O43295 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SRGAP3O43295 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SRGAP3O43295 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SRGAP3O43295 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SRGAP3O43295 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SRGAP3O43295 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SRGAP3O43295 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SRGAP3O43295 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SRGAP3O43295 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SRGAP3O43295 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SRGAP3O43295 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SRGAP3O43295 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SRGAP3O43295 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SRGAP3O43295 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SRGAP3O43295 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SRGAP3O43295 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SRGAP3O43295 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SRGAP3O43295 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SRGAP3O43295 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SRGAP3O43295 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SRGAP3O43295 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SRGAP3O43295 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SRGAP3O43295 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SRGAP3O43295 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SRGAP3O43295 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SRGAP3O43295 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SRGAP3O43295 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SRGAP3O43295 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SRGAP3O43295 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SRGAP3O43295 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SRGAP3O43295 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SRGAP3O43295 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SRGAP3O43295 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SRGAP3O43295 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SRGAP3O43295 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SRGAP3O43295 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SRGAP3O43295 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SRGAP3O43295 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SRGAP3O43295 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SRGAP3O43295 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SRGAP3O43295 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SRGAP3O43295 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SRGAP3O43295 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SRGAP3O43295 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SRGAP3O43295 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SRGAP3O43295 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SRGAP3O43295 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SRGAP3O43295 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SRGAP3O43295 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SRGAP3O43295 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SRGAP3O43295 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SRGAP3O43295 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SRGAP3O43295 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SRGAP3O43295 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SRGAP3O43295 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SRGAP3O43295 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SRGAP3O43295 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SRGAP3O43295 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SRGAP3O43295 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SRGAP3O43295 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SRGAP3O43295 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SRGAP3O43295 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SRGAP3O43295 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SRGAP3O43295 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SRGAP3O43295 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SRGAP3O43295 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SRGAP3O43295 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SRGAP3O43295 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SRGAP3O43295 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SRGAP3O43295 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SRGAP3O43295 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SRGAP3O43295 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SRGAP3O43295 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SRGAP3O43295 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SRGAP3O43295 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SRGAP3O43295 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SRGAP3O43295 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SRGAP3O43295 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SRGAP3O43295 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SRGAP3O43295 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
SRGAP3O43295 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
SRGAP3O43295 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SRGAP3O43295 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SRGAP3O43295 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SRGAP3O43295 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms