Protein–RNA interactions for Protein: O15205

UBD, Ubiquitin D, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBDO15205 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
UBDO15205 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
UBDO15205 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
UBDO15205 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
UBDO15205 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
UBDO15205 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
UBDO15205 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
UBDO15205 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
UBDO15205 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
UBDO15205 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
UBDO15205 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
UBDO15205 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
UBDO15205 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
UBDO15205 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
UBDO15205 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
UBDO15205 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
UBDO15205 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
UBDO15205 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
UBDO15205 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
UBDO15205 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
UBDO15205 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
UBDO15205 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
UBDO15205 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
UBDO15205 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
UBDO15205 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
UBDO15205 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
UBDO15205 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
UBDO15205 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
UBDO15205 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
UBDO15205 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
UBDO15205 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
UBDO15205 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
UBDO15205 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
UBDO15205 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
UBDO15205 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
UBDO15205 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
UBDO15205 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
UBDO15205 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
UBDO15205 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
UBDO15205 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
UBDO15205 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
UBDO15205 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
UBDO15205 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
UBDO15205 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
UBDO15205 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
UBDO15205 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
UBDO15205 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
UBDO15205 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
UBDO15205 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
UBDO15205 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
UBDO15205 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
UBDO15205 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
UBDO15205 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
UBDO15205 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
UBDO15205 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
UBDO15205 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
UBDO15205 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
UBDO15205 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
UBDO15205 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
UBDO15205 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
UBDO15205 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
UBDO15205 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
UBDO15205 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
UBDO15205 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
UBDO15205 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
UBDO15205 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
UBDO15205 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
UBDO15205 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
UBDO15205 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
UBDO15205 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
UBDO15205 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
UBDO15205 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
UBDO15205 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
UBDO15205 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
UBDO15205 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
UBDO15205 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
UBDO15205 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
UBDO15205 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
UBDO15205 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
UBDO15205 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
UBDO15205 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
UBDO15205 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
UBDO15205 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
UBDO15205 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
UBDO15205 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
UBDO15205 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
UBDO15205 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
UBDO15205 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
UBDO15205 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
UBDO15205 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
UBDO15205 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
UBDO15205 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
UBDO15205 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
UBDO15205 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
UBDO15205 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
UBDO15205 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
UBDO15205 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
UBDO15205 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
UBDO15205 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
UBDO15205 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms