Protein–RNA interactions for Protein: O15160

POLR1C, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1CO15160 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
POLR1CO15160 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
POLR1CO15160 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
POLR1CO15160 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
POLR1CO15160 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
POLR1CO15160 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
POLR1CO15160 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
POLR1CO15160 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
POLR1CO15160 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
POLR1CO15160 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
POLR1CO15160 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
POLR1CO15160 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
POLR1CO15160 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
POLR1CO15160 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
POLR1CO15160 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
POLR1CO15160 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
POLR1CO15160 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
POLR1CO15160 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
POLR1CO15160 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
POLR1CO15160 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
POLR1CO15160 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
POLR1CO15160 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
POLR1CO15160 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
POLR1CO15160 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
POLR1CO15160 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
POLR1CO15160 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
POLR1CO15160 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
POLR1CO15160 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
POLR1CO15160 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
POLR1CO15160 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
POLR1CO15160 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
POLR1CO15160 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
POLR1CO15160 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
POLR1CO15160 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
POLR1CO15160 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
POLR1CO15160 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
POLR1CO15160 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
POLR1CO15160 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
POLR1CO15160 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
POLR1CO15160 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
POLR1CO15160 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
POLR1CO15160 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
POLR1CO15160 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
POLR1CO15160 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
POLR1CO15160 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
POLR1CO15160 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
POLR1CO15160 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
POLR1CO15160 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
POLR1CO15160 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
POLR1CO15160 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
POLR1CO15160 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
POLR1CO15160 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
POLR1CO15160 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
POLR1CO15160 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
POLR1CO15160 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
POLR1CO15160 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
POLR1CO15160 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
POLR1CO15160 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
POLR1CO15160 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
POLR1CO15160 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
POLR1CO15160 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
POLR1CO15160 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
POLR1CO15160 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
POLR1CO15160 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
POLR1CO15160 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
POLR1CO15160 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
POLR1CO15160 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
POLR1CO15160 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
POLR1CO15160 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
POLR1CO15160 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
POLR1CO15160 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
POLR1CO15160 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
POLR1CO15160 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
POLR1CO15160 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
POLR1CO15160 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
POLR1CO15160 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
POLR1CO15160 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
POLR1CO15160 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
POLR1CO15160 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
POLR1CO15160 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
POLR1CO15160 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
POLR1CO15160 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
POLR1CO15160 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
POLR1CO15160 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
POLR1CO15160 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
POLR1CO15160 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
POLR1CO15160 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
POLR1CO15160 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
POLR1CO15160 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
POLR1CO15160 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
POLR1CO15160 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
POLR1CO15160 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
POLR1CO15160 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
POLR1CO15160 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
POLR1CO15160 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
POLR1CO15160 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
POLR1CO15160 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC18.83■□□□□ 0.6
POLR1CO15160 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
POLR1CO15160 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
POLR1CO15160 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms