Protein–RNA interactions for Protein: O15061

SYNM, Synemin, humanhuman

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNMO15061 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SYNMO15061 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SYNMO15061 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SYNMO15061 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SYNMO15061 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SYNMO15061 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
SYNMO15061 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SYNMO15061 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
SYNMO15061 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SYNMO15061 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SYNMO15061 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SYNMO15061 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SYNMO15061 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SYNMO15061 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
SYNMO15061 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SYNMO15061 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SYNMO15061 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SYNMO15061 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SYNMO15061 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
SYNMO15061 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SYNMO15061 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
SYNMO15061 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
SYNMO15061 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
SYNMO15061 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SYNMO15061 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SYNMO15061 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
SYNMO15061 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
SYNMO15061 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SYNMO15061 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SYNMO15061 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SYNMO15061 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SYNMO15061 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SYNMO15061 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SYNMO15061 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SYNMO15061 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SYNMO15061 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SYNMO15061 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SYNMO15061 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SYNMO15061 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
SYNMO15061 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SYNMO15061 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SYNMO15061 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SYNMO15061 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SYNMO15061 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SYNMO15061 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SYNMO15061 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SYNMO15061 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SYNMO15061 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SYNMO15061 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SYNMO15061 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SYNMO15061 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
SYNMO15061 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
SYNMO15061 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SYNMO15061 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SYNMO15061 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SYNMO15061 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SYNMO15061 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SYNMO15061 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SYNMO15061 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SYNMO15061 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SYNMO15061 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
SYNMO15061 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SYNMO15061 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SYNMO15061 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SYNMO15061 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SYNMO15061 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SYNMO15061 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
SYNMO15061 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SYNMO15061 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SYNMO15061 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SYNMO15061 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SYNMO15061 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SYNMO15061 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SYNMO15061 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SYNMO15061 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SYNMO15061 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SYNMO15061 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SYNMO15061 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SYNMO15061 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
SYNMO15061 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.12
SYNMO15061 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
SYNMO15061 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.12
SYNMO15061 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SYNMO15061 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
SYNMO15061 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SYNMO15061 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SYNMO15061 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SYNMO15061 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SYNMO15061 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SYNMO15061 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SYNMO15061 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SYNMO15061 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SYNMO15061 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SYNMO15061 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SYNMO15061 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SYNMO15061 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SYNMO15061 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SYNMO15061 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SYNMO15061 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SYNMO15061 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms