Protein–RNA interactions for Protein: O14896

IRF6, Interferon regulatory factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF6O14896 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IRF6O14896 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IRF6O14896 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IRF6O14896 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IRF6O14896 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IRF6O14896 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IRF6O14896 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IRF6O14896 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IRF6O14896 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IRF6O14896 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IRF6O14896 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IRF6O14896 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IRF6O14896 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IRF6O14896 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IRF6O14896 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IRF6O14896 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IRF6O14896 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IRF6O14896 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
IRF6O14896 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
IRF6O14896 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IRF6O14896 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IRF6O14896 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
IRF6O14896 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
IRF6O14896 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IRF6O14896 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IRF6O14896 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IRF6O14896 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IRF6O14896 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IRF6O14896 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IRF6O14896 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IRF6O14896 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
IRF6O14896 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IRF6O14896 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IRF6O14896 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IRF6O14896 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
IRF6O14896 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IRF6O14896 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IRF6O14896 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IRF6O14896 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IRF6O14896 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IRF6O14896 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IRF6O14896 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IRF6O14896 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
IRF6O14896 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IRF6O14896 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IRF6O14896 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IRF6O14896 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IRF6O14896 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IRF6O14896 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
IRF6O14896 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IRF6O14896 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IRF6O14896 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IRF6O14896 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IRF6O14896 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IRF6O14896 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IRF6O14896 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IRF6O14896 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IRF6O14896 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IRF6O14896 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IRF6O14896 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IRF6O14896 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IRF6O14896 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IRF6O14896 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IRF6O14896 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IRF6O14896 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IRF6O14896 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IRF6O14896 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
IRF6O14896 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IRF6O14896 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IRF6O14896 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
IRF6O14896 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
IRF6O14896 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IRF6O14896 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IRF6O14896 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IRF6O14896 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IRF6O14896 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IRF6O14896 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IRF6O14896 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IRF6O14896 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IRF6O14896 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IRF6O14896 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IRF6O14896 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IRF6O14896 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IRF6O14896 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IRF6O14896 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
IRF6O14896 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
IRF6O14896 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IRF6O14896 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
IRF6O14896 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IRF6O14896 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IRF6O14896 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IRF6O14896 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IRF6O14896 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IRF6O14896 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IRF6O14896 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IRF6O14896 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IRF6O14896 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IRF6O14896 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IRF6O14896 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IRF6O14896 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms