Protein–RNA interactions for Protein: O14802

POLR3A, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3AO14802 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
POLR3AO14802 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
POLR3AO14802 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
POLR3AO14802 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
POLR3AO14802 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
POLR3AO14802 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
POLR3AO14802 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
POLR3AO14802 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
POLR3AO14802 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
POLR3AO14802 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
POLR3AO14802 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
POLR3AO14802 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
POLR3AO14802 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
POLR3AO14802 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
POLR3AO14802 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
POLR3AO14802 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
POLR3AO14802 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
POLR3AO14802 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
POLR3AO14802 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
POLR3AO14802 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
POLR3AO14802 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
POLR3AO14802 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
POLR3AO14802 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
POLR3AO14802 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
POLR3AO14802 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
POLR3AO14802 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
POLR3AO14802 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
POLR3AO14802 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
POLR3AO14802 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
POLR3AO14802 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
POLR3AO14802 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
POLR3AO14802 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
POLR3AO14802 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
POLR3AO14802 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
POLR3AO14802 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
POLR3AO14802 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
POLR3AO14802 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
POLR3AO14802 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC26.92■■□□□ 1.9
POLR3AO14802 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
POLR3AO14802 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
POLR3AO14802 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
POLR3AO14802 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
POLR3AO14802 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
POLR3AO14802 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
POLR3AO14802 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
POLR3AO14802 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
POLR3AO14802 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
POLR3AO14802 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
POLR3AO14802 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
POLR3AO14802 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
POLR3AO14802 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
POLR3AO14802 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
POLR3AO14802 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
POLR3AO14802 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
POLR3AO14802 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
POLR3AO14802 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
POLR3AO14802 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
POLR3AO14802 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
POLR3AO14802 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
POLR3AO14802 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
POLR3AO14802 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
POLR3AO14802 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
POLR3AO14802 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
POLR3AO14802 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
POLR3AO14802 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
POLR3AO14802 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
POLR3AO14802 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
POLR3AO14802 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
POLR3AO14802 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
POLR3AO14802 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
POLR3AO14802 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
POLR3AO14802 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
POLR3AO14802 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
POLR3AO14802 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
POLR3AO14802 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
POLR3AO14802 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
POLR3AO14802 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
POLR3AO14802 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
POLR3AO14802 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
POLR3AO14802 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
POLR3AO14802 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
POLR3AO14802 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
POLR3AO14802 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
POLR3AO14802 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
POLR3AO14802 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
POLR3AO14802 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
POLR3AO14802 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC26.89■■□□□ 1.9
POLR3AO14802 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
POLR3AO14802 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
POLR3AO14802 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
POLR3AO14802 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
POLR3AO14802 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
POLR3AO14802 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.89
POLR3AO14802 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
POLR3AO14802 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
POLR3AO14802 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
POLR3AO14802 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
POLR3AO14802 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
POLR3AO14802 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
POLR3AO14802 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms