Protein–RNA interactions for Protein: O14727

APAF1, Apoptotic protease-activating factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APAF1O14727 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
APAF1O14727 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
APAF1O14727 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
APAF1O14727 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
APAF1O14727 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
APAF1O14727 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
APAF1O14727 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
APAF1O14727 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
APAF1O14727 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
APAF1O14727 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
APAF1O14727 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
APAF1O14727 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
APAF1O14727 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
APAF1O14727 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
APAF1O14727 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
APAF1O14727 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
APAF1O14727 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
APAF1O14727 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
APAF1O14727 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
APAF1O14727 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
APAF1O14727 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
APAF1O14727 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
APAF1O14727 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
APAF1O14727 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
APAF1O14727 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
APAF1O14727 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
APAF1O14727 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
APAF1O14727 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
APAF1O14727 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
APAF1O14727 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
APAF1O14727 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
APAF1O14727 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
APAF1O14727 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
APAF1O14727 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
APAF1O14727 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
APAF1O14727 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
APAF1O14727 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
APAF1O14727 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
APAF1O14727 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
APAF1O14727 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
APAF1O14727 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
APAF1O14727 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
APAF1O14727 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
APAF1O14727 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
APAF1O14727 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
APAF1O14727 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
APAF1O14727 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
APAF1O14727 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
APAF1O14727 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
APAF1O14727 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
APAF1O14727 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
APAF1O14727 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
APAF1O14727 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
APAF1O14727 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
APAF1O14727 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
APAF1O14727 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
APAF1O14727 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
APAF1O14727 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
APAF1O14727 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
APAF1O14727 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
APAF1O14727 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
APAF1O14727 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
APAF1O14727 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
APAF1O14727 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
APAF1O14727 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
APAF1O14727 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
APAF1O14727 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
APAF1O14727 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
APAF1O14727 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
APAF1O14727 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
APAF1O14727 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
APAF1O14727 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
APAF1O14727 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
APAF1O14727 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
APAF1O14727 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
APAF1O14727 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
APAF1O14727 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
APAF1O14727 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
APAF1O14727 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
APAF1O14727 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
APAF1O14727 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
APAF1O14727 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
APAF1O14727 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
APAF1O14727 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
APAF1O14727 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
APAF1O14727 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
APAF1O14727 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
APAF1O14727 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
APAF1O14727 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
APAF1O14727 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
APAF1O14727 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
APAF1O14727 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
APAF1O14727 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
APAF1O14727 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
APAF1O14727 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
APAF1O14727 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
APAF1O14727 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
APAF1O14727 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
APAF1O14727 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
APAF1O14727 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms