Protein–RNA interactions for Protein: O00411

POLRMT, DNA-directed RNA polymerase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLRMTO00411 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
POLRMTO00411 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
POLRMTO00411 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
POLRMTO00411 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
POLRMTO00411 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
POLRMTO00411 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
POLRMTO00411 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
POLRMTO00411 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
POLRMTO00411 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
POLRMTO00411 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
POLRMTO00411 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
POLRMTO00411 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
POLRMTO00411 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
POLRMTO00411 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
POLRMTO00411 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
POLRMTO00411 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
POLRMTO00411 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
POLRMTO00411 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
POLRMTO00411 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
POLRMTO00411 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
POLRMTO00411 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
POLRMTO00411 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
POLRMTO00411 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
POLRMTO00411 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
POLRMTO00411 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
POLRMTO00411 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
POLRMTO00411 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
POLRMTO00411 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
POLRMTO00411 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
POLRMTO00411 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
POLRMTO00411 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
POLRMTO00411 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
POLRMTO00411 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
POLRMTO00411 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
POLRMTO00411 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
POLRMTO00411 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
POLRMTO00411 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
POLRMTO00411 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
POLRMTO00411 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
POLRMTO00411 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
POLRMTO00411 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
POLRMTO00411 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
POLRMTO00411 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
POLRMTO00411 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
POLRMTO00411 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
POLRMTO00411 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
POLRMTO00411 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
POLRMTO00411 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
POLRMTO00411 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
POLRMTO00411 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
POLRMTO00411 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
POLRMTO00411 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
POLRMTO00411 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
POLRMTO00411 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
POLRMTO00411 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
POLRMTO00411 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
POLRMTO00411 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
POLRMTO00411 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
POLRMTO00411 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
POLRMTO00411 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
POLRMTO00411 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
POLRMTO00411 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
POLRMTO00411 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
POLRMTO00411 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
POLRMTO00411 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
POLRMTO00411 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
POLRMTO00411 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
POLRMTO00411 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
POLRMTO00411 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
POLRMTO00411 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
POLRMTO00411 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
POLRMTO00411 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
POLRMTO00411 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
POLRMTO00411 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
POLRMTO00411 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
POLRMTO00411 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
POLRMTO00411 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
POLRMTO00411 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
POLRMTO00411 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
POLRMTO00411 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
POLRMTO00411 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
POLRMTO00411 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
POLRMTO00411 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
POLRMTO00411 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
POLRMTO00411 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
POLRMTO00411 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
POLRMTO00411 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
POLRMTO00411 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
POLRMTO00411 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
POLRMTO00411 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
POLRMTO00411 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
POLRMTO00411 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
POLRMTO00411 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
POLRMTO00411 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
POLRMTO00411 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
POLRMTO00411 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
POLRMTO00411 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
POLRMTO00411 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
POLRMTO00411 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
POLRMTO00411 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms