Protein–RNA interactions for Protein: M5A8F1

ERVH48-1, Suppressyn, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVH48-1M5A8F1 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVH48-1M5A8F1 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVH48-1M5A8F1 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVH48-1M5A8F1 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVH48-1M5A8F1 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVH48-1M5A8F1 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVH48-1M5A8F1 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVH48-1M5A8F1 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVH48-1M5A8F1 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVH48-1M5A8F1 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVH48-1M5A8F1 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVH48-1M5A8F1 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVH48-1M5A8F1 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVH48-1M5A8F1 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVH48-1M5A8F1 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVH48-1M5A8F1 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVH48-1M5A8F1 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVH48-1M5A8F1 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVH48-1M5A8F1 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVH48-1M5A8F1 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVH48-1M5A8F1 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVH48-1M5A8F1 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVH48-1M5A8F1 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVH48-1M5A8F1 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVH48-1M5A8F1 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVH48-1M5A8F1 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVH48-1M5A8F1 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVH48-1M5A8F1 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVH48-1M5A8F1 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVH48-1M5A8F1 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVH48-1M5A8F1 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVH48-1M5A8F1 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVH48-1M5A8F1 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVH48-1M5A8F1 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVH48-1M5A8F1 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVH48-1M5A8F1 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVH48-1M5A8F1 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVH48-1M5A8F1 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVH48-1M5A8F1 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVH48-1M5A8F1 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVH48-1M5A8F1 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVH48-1M5A8F1 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVH48-1M5A8F1 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVH48-1M5A8F1 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVH48-1M5A8F1 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVH48-1M5A8F1 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVH48-1M5A8F1 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVH48-1M5A8F1 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVH48-1M5A8F1 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVH48-1M5A8F1 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVH48-1M5A8F1 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVH48-1M5A8F1 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVH48-1M5A8F1 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVH48-1M5A8F1 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVH48-1M5A8F1 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVH48-1M5A8F1 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVH48-1M5A8F1 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVH48-1M5A8F1 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVH48-1M5A8F1 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVH48-1M5A8F1 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERVH48-1M5A8F1 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERVH48-1M5A8F1 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERVH48-1M5A8F1 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERVH48-1M5A8F1 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERVH48-1M5A8F1 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERVH48-1M5A8F1 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERVH48-1M5A8F1 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERVH48-1M5A8F1 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERVH48-1M5A8F1 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERVH48-1M5A8F1 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERVH48-1M5A8F1 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ERVH48-1M5A8F1 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERVH48-1M5A8F1 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERVH48-1M5A8F1 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ERVH48-1M5A8F1 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERVH48-1M5A8F1 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERVH48-1M5A8F1 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERVH48-1M5A8F1 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERVH48-1M5A8F1 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
ERVH48-1M5A8F1 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVH48-1M5A8F1 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVH48-1M5A8F1 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVH48-1M5A8F1 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVH48-1M5A8F1 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVH48-1M5A8F1 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVH48-1M5A8F1 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVH48-1M5A8F1 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVH48-1M5A8F1 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVH48-1M5A8F1 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVH48-1M5A8F1 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVH48-1M5A8F1 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVH48-1M5A8F1 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVH48-1M5A8F1 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVH48-1M5A8F1 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVH48-1M5A8F1 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVH48-1M5A8F1 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVH48-1M5A8F1 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVH48-1M5A8F1 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVH48-1M5A8F1 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVH48-1M5A8F1 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms