Protein–RNA interactions for Protein: H3BVE0

BOLA2-SMG1P6, BOLA2-SMG1P6 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms