Protein–RNA interactions for Protein: E9PMD0

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PMD0 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
E9PMD0 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
E9PMD0 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
E9PMD0 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
E9PMD0 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
E9PMD0 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
E9PMD0 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
E9PMD0 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
E9PMD0 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
E9PMD0 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
E9PMD0 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
E9PMD0 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
E9PMD0 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
E9PMD0 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
E9PMD0 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
E9PMD0 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
E9PMD0 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
E9PMD0 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
E9PMD0 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
E9PMD0 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
E9PMD0 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
E9PMD0 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
E9PMD0 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
E9PMD0 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
E9PMD0 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
E9PMD0 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
E9PMD0 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
E9PMD0 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
E9PMD0 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
E9PMD0 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
E9PMD0 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
E9PMD0 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
E9PMD0 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
E9PMD0 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
E9PMD0 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
E9PMD0 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
E9PMD0 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
E9PMD0 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
E9PMD0 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
E9PMD0 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
E9PMD0 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
E9PMD0 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
E9PMD0 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
E9PMD0 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
E9PMD0 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
E9PMD0 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
E9PMD0 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
E9PMD0 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
E9PMD0 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
E9PMD0 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
E9PMD0 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
E9PMD0 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
E9PMD0 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
E9PMD0 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
E9PMD0 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
E9PMD0 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
E9PMD0 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
E9PMD0 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
E9PMD0 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
E9PMD0 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
E9PMD0 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
E9PMD0 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
E9PMD0 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
E9PMD0 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
E9PMD0 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
E9PMD0 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
E9PMD0 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
E9PMD0 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
E9PMD0 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
E9PMD0 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
E9PMD0 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
E9PMD0 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
E9PMD0 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
E9PMD0 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
E9PMD0 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
E9PMD0 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
E9PMD0 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
E9PMD0 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
E9PMD0 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
E9PMD0 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
E9PMD0 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
E9PMD0 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
E9PMD0 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
E9PMD0 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
E9PMD0 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
E9PMD0 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
E9PMD0 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
E9PMD0 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
E9PMD0 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
E9PMD0 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
E9PMD0 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
E9PMD0 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
E9PMD0 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
E9PMD0 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
E9PMD0 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
E9PMD0 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
E9PMD0 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
E9PMD0 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
E9PMD0 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
E9PMD0 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms