Protein–RNA interactions for Protein: B7Z1M9

C2CD4D, C2 calcium-dependent domain-containing protein 4D, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2CD4DB7Z1M9 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
C2CD4DB7Z1M9 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C2CD4DB7Z1M9 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
C2CD4DB7Z1M9 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
C2CD4DB7Z1M9 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
C2CD4DB7Z1M9 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
C2CD4DB7Z1M9 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
C2CD4DB7Z1M9 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C2CD4DB7Z1M9 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C2CD4DB7Z1M9 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
C2CD4DB7Z1M9 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C2CD4DB7Z1M9 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
C2CD4DB7Z1M9 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
C2CD4DB7Z1M9 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C2CD4DB7Z1M9 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C2CD4DB7Z1M9 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
C2CD4DB7Z1M9 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C2CD4DB7Z1M9 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
C2CD4DB7Z1M9 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
C2CD4DB7Z1M9 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
C2CD4DB7Z1M9 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
C2CD4DB7Z1M9 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
C2CD4DB7Z1M9 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
C2CD4DB7Z1M9 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C2CD4DB7Z1M9 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C2CD4DB7Z1M9 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C2CD4DB7Z1M9 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C2CD4DB7Z1M9 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C2CD4DB7Z1M9 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
C2CD4DB7Z1M9 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
C2CD4DB7Z1M9 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C2CD4DB7Z1M9 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C2CD4DB7Z1M9 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C2CD4DB7Z1M9 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C2CD4DB7Z1M9 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
C2CD4DB7Z1M9 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
C2CD4DB7Z1M9 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
C2CD4DB7Z1M9 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
C2CD4DB7Z1M9 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C2CD4DB7Z1M9 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C2CD4DB7Z1M9 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
C2CD4DB7Z1M9 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C2CD4DB7Z1M9 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C2CD4DB7Z1M9 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C2CD4DB7Z1M9 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C2CD4DB7Z1M9 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C2CD4DB7Z1M9 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C2CD4DB7Z1M9 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C2CD4DB7Z1M9 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C2CD4DB7Z1M9 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C2CD4DB7Z1M9 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C2CD4DB7Z1M9 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C2CD4DB7Z1M9 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C2CD4DB7Z1M9 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C2CD4DB7Z1M9 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C2CD4DB7Z1M9 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C2CD4DB7Z1M9 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
C2CD4DB7Z1M9 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C2CD4DB7Z1M9 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C2CD4DB7Z1M9 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C2CD4DB7Z1M9 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C2CD4DB7Z1M9 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C2CD4DB7Z1M9 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C2CD4DB7Z1M9 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C2CD4DB7Z1M9 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C2CD4DB7Z1M9 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C2CD4DB7Z1M9 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C2CD4DB7Z1M9 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C2CD4DB7Z1M9 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
C2CD4DB7Z1M9 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C2CD4DB7Z1M9 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C2CD4DB7Z1M9 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
C2CD4DB7Z1M9 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C2CD4DB7Z1M9 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C2CD4DB7Z1M9 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
C2CD4DB7Z1M9 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C2CD4DB7Z1M9 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C2CD4DB7Z1M9 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C2CD4DB7Z1M9 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C2CD4DB7Z1M9 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
C2CD4DB7Z1M9 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
C2CD4DB7Z1M9 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C2CD4DB7Z1M9 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C2CD4DB7Z1M9 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
C2CD4DB7Z1M9 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
C2CD4DB7Z1M9 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
C2CD4DB7Z1M9 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
C2CD4DB7Z1M9 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
C2CD4DB7Z1M9 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C2CD4DB7Z1M9 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C2CD4DB7Z1M9 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C2CD4DB7Z1M9 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C2CD4DB7Z1M9 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
C2CD4DB7Z1M9 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
C2CD4DB7Z1M9 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
C2CD4DB7Z1M9 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
C2CD4DB7Z1M9 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
C2CD4DB7Z1M9 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
C2CD4DB7Z1M9 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
C2CD4DB7Z1M9 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms