Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SOBPA7XYQ1 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SOBPA7XYQ1 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SOBPA7XYQ1 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SOBPA7XYQ1 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SOBPA7XYQ1 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SOBPA7XYQ1 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SOBPA7XYQ1 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SOBPA7XYQ1 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SOBPA7XYQ1 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SOBPA7XYQ1 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SOBPA7XYQ1 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SOBPA7XYQ1 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SOBPA7XYQ1 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SOBPA7XYQ1 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SOBPA7XYQ1 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SOBPA7XYQ1 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SOBPA7XYQ1 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SOBPA7XYQ1 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SOBPA7XYQ1 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SOBPA7XYQ1 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SOBPA7XYQ1 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SOBPA7XYQ1 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SOBPA7XYQ1 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SOBPA7XYQ1 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SOBPA7XYQ1 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SOBPA7XYQ1 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SOBPA7XYQ1 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SOBPA7XYQ1 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SOBPA7XYQ1 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SOBPA7XYQ1 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SOBPA7XYQ1 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SOBPA7XYQ1 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SOBPA7XYQ1 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SOBPA7XYQ1 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SOBPA7XYQ1 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SOBPA7XYQ1 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SOBPA7XYQ1 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SOBPA7XYQ1 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SOBPA7XYQ1 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SOBPA7XYQ1 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SOBPA7XYQ1 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SOBPA7XYQ1 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SOBPA7XYQ1 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SOBPA7XYQ1 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SOBPA7XYQ1 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SOBPA7XYQ1 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SOBPA7XYQ1 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SOBPA7XYQ1 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SOBPA7XYQ1 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SOBPA7XYQ1 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
SOBPA7XYQ1 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SOBPA7XYQ1 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SOBPA7XYQ1 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SOBPA7XYQ1 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SOBPA7XYQ1 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SOBPA7XYQ1 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
SOBPA7XYQ1 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SOBPA7XYQ1 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SOBPA7XYQ1 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
SOBPA7XYQ1 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SOBPA7XYQ1 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SOBPA7XYQ1 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SOBPA7XYQ1 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SOBPA7XYQ1 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SOBPA7XYQ1 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SOBPA7XYQ1 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SOBPA7XYQ1 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SOBPA7XYQ1 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SOBPA7XYQ1 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SOBPA7XYQ1 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SOBPA7XYQ1 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
SOBPA7XYQ1 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SOBPA7XYQ1 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SOBPA7XYQ1 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
SOBPA7XYQ1 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SOBPA7XYQ1 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SOBPA7XYQ1 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SOBPA7XYQ1 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SOBPA7XYQ1 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SOBPA7XYQ1 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SOBPA7XYQ1 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
SOBPA7XYQ1 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SOBPA7XYQ1 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SOBPA7XYQ1 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SOBPA7XYQ1 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SOBPA7XYQ1 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SOBPA7XYQ1 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SOBPA7XYQ1 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SOBPA7XYQ1 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SOBPA7XYQ1 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SOBPA7XYQ1 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SOBPA7XYQ1 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SOBPA7XYQ1 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SOBPA7XYQ1 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SOBPA7XYQ1 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SOBPA7XYQ1 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SOBPA7XYQ1 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
SOBPA7XYQ1 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SOBPA7XYQ1 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
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