Protein–RNA interactions for Protein: A6NJW9

CD8B2, Putative T-cell surface glycoprotein CD8 beta-2 chain, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD8B2A6NJW9 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CD8B2A6NJW9 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CD8B2A6NJW9 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CD8B2A6NJW9 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CD8B2A6NJW9 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CD8B2A6NJW9 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CD8B2A6NJW9 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CD8B2A6NJW9 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CD8B2A6NJW9 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CD8B2A6NJW9 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CD8B2A6NJW9 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CD8B2A6NJW9 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CD8B2A6NJW9 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CD8B2A6NJW9 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CD8B2A6NJW9 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CD8B2A6NJW9 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CD8B2A6NJW9 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CD8B2A6NJW9 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CD8B2A6NJW9 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CD8B2A6NJW9 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CD8B2A6NJW9 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CD8B2A6NJW9 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CD8B2A6NJW9 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CD8B2A6NJW9 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CD8B2A6NJW9 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CD8B2A6NJW9 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CD8B2A6NJW9 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CD8B2A6NJW9 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CD8B2A6NJW9 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CD8B2A6NJW9 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CD8B2A6NJW9 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CD8B2A6NJW9 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CD8B2A6NJW9 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CD8B2A6NJW9 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CD8B2A6NJW9 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CD8B2A6NJW9 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CD8B2A6NJW9 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CD8B2A6NJW9 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CD8B2A6NJW9 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CD8B2A6NJW9 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CD8B2A6NJW9 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CD8B2A6NJW9 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CD8B2A6NJW9 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CD8B2A6NJW9 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CD8B2A6NJW9 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CD8B2A6NJW9 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CD8B2A6NJW9 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CD8B2A6NJW9 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CD8B2A6NJW9 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD8B2A6NJW9 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD8B2A6NJW9 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD8B2A6NJW9 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CD8B2A6NJW9 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD8B2A6NJW9 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD8B2A6NJW9 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD8B2A6NJW9 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD8B2A6NJW9 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD8B2A6NJW9 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD8B2A6NJW9 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD8B2A6NJW9 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD8B2A6NJW9 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD8B2A6NJW9 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD8B2A6NJW9 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD8B2A6NJW9 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD8B2A6NJW9 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD8B2A6NJW9 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD8B2A6NJW9 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD8B2A6NJW9 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD8B2A6NJW9 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CD8B2A6NJW9 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD8B2A6NJW9 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD8B2A6NJW9 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD8B2A6NJW9 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD8B2A6NJW9 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD8B2A6NJW9 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD8B2A6NJW9 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD8B2A6NJW9 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD8B2A6NJW9 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD8B2A6NJW9 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD8B2A6NJW9 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD8B2A6NJW9 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD8B2A6NJW9 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD8B2A6NJW9 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD8B2A6NJW9 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD8B2A6NJW9 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD8B2A6NJW9 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD8B2A6NJW9 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD8B2A6NJW9 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CD8B2A6NJW9 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD8B2A6NJW9 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD8B2A6NJW9 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD8B2A6NJW9 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD8B2A6NJW9 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD8B2A6NJW9 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD8B2A6NJW9 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD8B2A6NJW9 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CD8B2A6NJW9 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD8B2A6NJW9 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD8B2A6NJW9 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD8B2A6NJW9 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms