Protein–RNA interactions for Protein: A6NCI5

LINC00862, Putative transmembrane protein encoded by LINC00862, humanhuman

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00862A6NCI5 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00862A6NCI5 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00862A6NCI5 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00862A6NCI5 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00862A6NCI5 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00862A6NCI5 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00862A6NCI5 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00862A6NCI5 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00862A6NCI5 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00862A6NCI5 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00862A6NCI5 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00862A6NCI5 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00862A6NCI5 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00862A6NCI5 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00862A6NCI5 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00862A6NCI5 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00862A6NCI5 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00862A6NCI5 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00862A6NCI5 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00862A6NCI5 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00862A6NCI5 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00862A6NCI5 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00862A6NCI5 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00862A6NCI5 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00862A6NCI5 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00862A6NCI5 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00862A6NCI5 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00862A6NCI5 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00862A6NCI5 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00862A6NCI5 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00862A6NCI5 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00862A6NCI5 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00862A6NCI5 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00862A6NCI5 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00862A6NCI5 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00862A6NCI5 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00862A6NCI5 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00862A6NCI5 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00862A6NCI5 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00862A6NCI5 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00862A6NCI5 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
LINC00862A6NCI5 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
LINC00862A6NCI5 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
LINC00862A6NCI5 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
LINC00862A6NCI5 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
LINC00862A6NCI5 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
LINC00862A6NCI5 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
LINC00862A6NCI5 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00862A6NCI5 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00862A6NCI5 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00862A6NCI5 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00862A6NCI5 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00862A6NCI5 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00862A6NCI5 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00862A6NCI5 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00862A6NCI5 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00862A6NCI5 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00862A6NCI5 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00862A6NCI5 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00862A6NCI5 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00862A6NCI5 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00862A6NCI5 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00862A6NCI5 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00862A6NCI5 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00862A6NCI5 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00862A6NCI5 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00862A6NCI5 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00862A6NCI5 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00862A6NCI5 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00862A6NCI5 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00862A6NCI5 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00862A6NCI5 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00862A6NCI5 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00862A6NCI5 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00862A6NCI5 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00862A6NCI5 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00862A6NCI5 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00862A6NCI5 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00862A6NCI5 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00862A6NCI5 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00862A6NCI5 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00862A6NCI5 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00862A6NCI5 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00862A6NCI5 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00862A6NCI5 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00862A6NCI5 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00862A6NCI5 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00862A6NCI5 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00862A6NCI5 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00862A6NCI5 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00862A6NCI5 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00862A6NCI5 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00862A6NCI5 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00862A6NCI5 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00862A6NCI5 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00862A6NCI5 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00862A6NCI5 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00862A6NCI5 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00862A6NCI5 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00862A6NCI5 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms