Protein–RNA interactions for Protein: A2RUT3

TMEM89, Transmembrane protein 89, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM89A2RUT3 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM89A2RUT3 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM89A2RUT3 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM89A2RUT3 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM89A2RUT3 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM89A2RUT3 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM89A2RUT3 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM89A2RUT3 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM89A2RUT3 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM89A2RUT3 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM89A2RUT3 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM89A2RUT3 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM89A2RUT3 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM89A2RUT3 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM89A2RUT3 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM89A2RUT3 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM89A2RUT3 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM89A2RUT3 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM89A2RUT3 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM89A2RUT3 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM89A2RUT3 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM89A2RUT3 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM89A2RUT3 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM89A2RUT3 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM89A2RUT3 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM89A2RUT3 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM89A2RUT3 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM89A2RUT3 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM89A2RUT3 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM89A2RUT3 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM89A2RUT3 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM89A2RUT3 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TMEM89A2RUT3 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TMEM89A2RUT3 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TMEM89A2RUT3 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TMEM89A2RUT3 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM89A2RUT3 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM89A2RUT3 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM89A2RUT3 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM89A2RUT3 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM89A2RUT3 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM89A2RUT3 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM89A2RUT3 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM89A2RUT3 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM89A2RUT3 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM89A2RUT3 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM89A2RUT3 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM89A2RUT3 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM89A2RUT3 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM89A2RUT3 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM89A2RUT3 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM89A2RUT3 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM89A2RUT3 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM89A2RUT3 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM89A2RUT3 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM89A2RUT3 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM89A2RUT3 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM89A2RUT3 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM89A2RUT3 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM89A2RUT3 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM89A2RUT3 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM89A2RUT3 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM89A2RUT3 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM89A2RUT3 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM89A2RUT3 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM89A2RUT3 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM89A2RUT3 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM89A2RUT3 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM89A2RUT3 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM89A2RUT3 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM89A2RUT3 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM89A2RUT3 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM89A2RUT3 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM89A2RUT3 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM89A2RUT3 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM89A2RUT3 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM89A2RUT3 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM89A2RUT3 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM89A2RUT3 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM89A2RUT3 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM89A2RUT3 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM89A2RUT3 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM89A2RUT3 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM89A2RUT3 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM89A2RUT3 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM89A2RUT3 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM89A2RUT3 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM89A2RUT3 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM89A2RUT3 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM89A2RUT3 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM89A2RUT3 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM89A2RUT3 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM89A2RUT3 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM89A2RUT3 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM89A2RUT3 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM89A2RUT3 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM89A2RUT3 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM89A2RUT3 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM89A2RUT3 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM89A2RUT3 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms