Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 AC063979.2-201ENST00000513767 958 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
COPS7AQ9UBW8 AC040914.1-201ENST00000518674 318 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
COPS7AQ9UBW8 IGHVIII-76-1-201ENST00000523776 286 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
COPS7AQ9UBW8 AP001085.1-201ENST00000524441 639 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
COPS7AQ9UBW8 AP001266.2-201ENST00000534505 464 ntTSL 4 BASIC5.1□□□□□ -1.59
COPS7AQ9UBW8 MIR4307HG-201ENST00000548170 822 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
COPS7AQ9UBW8 LIMA1-215ENST00000552823 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
COPS7AQ9UBW8 AC009113.2-201ENST00000563182 403 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
COPS7AQ9UBW8 RPS15A-203ENST00000563390 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
COPS7AQ9UBW8 DLGAP1-AS2-202ENST00000573177 1388 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
COPS7AQ9UBW8 AP005403.1-201ENST00000579720 229 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
COPS7AQ9UBW8 SNORD39.2-201ENST00000579995 76 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
COPS7AQ9UBW8 AP005121.1-202ENST00000584414 555 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
COPS7AQ9UBW8 AC100775.1-201ENST00000590942 522 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
COPS7AQ9UBW8 OSBPL9P1-201ENST00000604744 1469 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
COPS7AQ9UBW8 AC012213.4-201ENST00000606457 354 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
COPS7AQ9UBW8 PROX1-AS1-219ENST00000610094 791 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
COPS7AQ9UBW8 AC005840.5-201ENST00000619166 599 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
COPS7AQ9UBW8 PXT1-202ENST00000619547 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
COPS7AQ9UBW8 uc_338.7-201ENST00000621834 124 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
COPS7AQ9UBW8 AC015799.1-201ENST00000622996 3122 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
COPS7AQ9UBW8 AL359094.1-202ENST00000629917 1113 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
COPS7AQ9UBW8 LINC00254-202ENST00000633813 439 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
COPS7AQ9UBW8 OR8S1-202ENST00000641651 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.1□□□□□ -1.59
COPS7AQ9UBW8 Z95331.1-201ENST00000623075 23112 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
COPS7AQ9UBW8 AC138907.8-201ENST00000623981 2256 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
COPS7AQ9UBW8 RPGRIP1L-201ENST00000262135 8195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
COPS7AQ9UBW8 SLFN12L-205ENST00000628453 1767 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
COPS7AQ9UBW8 MTCO1P11-201ENST00000429111 1528 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
COPS7AQ9UBW8 CFH-201ENST00000359637 1454 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
COPS7AQ9UBW8 LINC01748-204ENST00000635048 5678 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
COPS7AQ9UBW8 AC079097.1-201ENST00000512187 1399 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
COPS7AQ9UBW8 PLCH1-AS1-201ENST00000475196 1308 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
COPS7AQ9UBW8 RN7SKP160-201ENST00000363804 340 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
COPS7AQ9UBW8 RNA5SP234-201ENST00000363916 119 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
COPS7AQ9UBW8 RNU6-819P-201ENST00000364116 107 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
COPS7AQ9UBW8 USMG5-203ENST00000369811 635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
COPS7AQ9UBW8 MIR323B-201ENST00000385269 82 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
COPS7AQ9UBW8 AL139039.2-201ENST00000407436 479 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
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COPS7AQ9UBW8 RN7SKP59-201ENST00000410520 314 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
COPS7AQ9UBW8 RNU6-564P-201ENST00000410983 104 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
COPS7AQ9UBW8 AC007064.3-201ENST00000422608 359 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
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COPS7AQ9UBW8 AC073465.2-201ENST00000440938 498 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
COPS7AQ9UBW8 AL353764.1-201ENST00000442072 474 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
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COPS7AQ9UBW8 HHLA2-209ENST00000489514 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 TET2-203ENST00000380013 9679 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 ESRRG-202ENST00000360012 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 AC009962.1-201ENST00000567327 3813 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 LINC02227-201ENST00000619068 3748 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 SMARCA2-201ENST00000302401 2242 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 SMNDC1-202ENST00000369603 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 AC003973.3-201ENST00000624863 2822 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 RAB18-209ENST00000621805 4894 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 FYB1-204ENST00000505428 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 C11orf65-208ENST00000615746 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 AC093155.3-201ENST00000370548 2013 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 CASP5-208ENST00000526056 1344 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 RPL39P5-201ENST00000273411 449 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 TMBIM4-201ENST00000286424 989 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 OR11H6-201ENST00000315519 993 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 LIX1L-AS1-201ENST00000366105 377 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
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