Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 DSCR8-201ENST00000357704 552 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
USP35Q9P2H5 RNU4-31P-201ENST00000384211 141 ntBASIC8□□□□□ -1.13
USP35Q9P2H5 DSCR8-202ENST00000400477 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
USP35Q9P2H5 AL121835.1-201ENST00000404250 354 ntBASIC8□□□□□ -1.13
USP35Q9P2H5 MRPL53P1-201ENST00000414323 319 ntBASIC8□□□□□ -1.13
USP35Q9P2H5 AL590399.4-201ENST00000436561 601 ntBASIC8□□□□□ -1.13
USP35Q9P2H5 AC092967.1-201ENST00000449016 481 ntBASIC8□□□□□ -1.13
USP35Q9P2H5 PSMC1P13-201ENST00000458195 985 ntBASIC8□□□□□ -1.13
USP35Q9P2H5 CDH12P2-201ENST00000504393 298 ntBASIC8□□□□□ -1.13
USP35Q9P2H5 AC068672.3-203ENST00000505166 311 ntTSL 3 BASIC8□□□□□ -1.13
USP35Q9P2H5 LINC02039-201ENST00000507428 566 ntTSL 4 BASIC8□□□□□ -1.13
USP35Q9P2H5 GAPDHP71-201ENST00000511530 1003 ntBASIC8□□□□□ -1.13
USP35Q9P2H5 LINC00534-203ENST00000523406 812 ntTSL 3 BASIC8□□□□□ -1.13
USP35Q9P2H5 LDHC-203ENST00000535809 757 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
USP35Q9P2H5 KLRK1-204ENST00000540818 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
USP35Q9P2H5 FAM222A-AS1-202ENST00000541460 751 ntTSL 4 BASIC8□□□□□ -1.13
USP35Q9P2H5 SLC14A2-AS1-201ENST00000585759 494 ntTSL 3 BASIC8□□□□□ -1.13
USP35Q9P2H5 FKBP1AP1-201ENST00000594588 318 ntBASIC8□□□□□ -1.13
USP35Q9P2H5 AC025175.1-201ENST00000606482 759 ntBASIC8□□□□□ -1.13
USP35Q9P2H5 AL139022.2-201ENST00000606934 443 ntBASIC8□□□□□ -1.13
USP35Q9P2H5 AL451049.1-201ENST00000608672 497 ntBASIC8□□□□□ -1.13
USP35Q9P2H5 AC112503.2-201ENST00000609005 552 ntBASIC8□□□□□ -1.13
USP35Q9P2H5 RN7SL544P-201ENST00000617232 284 ntBASIC8□□□□□ -1.13
USP35Q9P2H5 AC243829.4-201ENST00000620056 701 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
USP35Q9P2H5 RN7SL763P-201ENST00000620922 284 ntBASIC8□□□□□ -1.13
USP35Q9P2H5 CCL14-204ENST00000622526 472 ntTSL 3 BASIC8□□□□□ -1.13
USP35Q9P2H5 ATM-229ENST00000639953 587 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
USP35Q9P2H5 SAMMSON-227ENST00000642114 1199 ntBASIC8□□□□□ -1.13
USP35Q9P2H5 PSD3-219ENST00000614430 6136 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
USP35Q9P2H5 MUT-201ENST00000274813 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
USP35Q9P2H5 PDE4D-228ENST00000636120 6659 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
USP35Q9P2H5 AL034546.1-201ENST00000623740 3693 ntBASIC8□□□□□ -1.13
USP35Q9P2H5 DTNA-206ENST00000399121 6490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
USP35Q9P2H5 AC091045.1-201ENST00000561460 2277 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
USP35Q9P2H5 NBPF12-204ENST00000613714 2701 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
USP35Q9P2H5 USMG5-201ENST00000309579 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
USP35Q9P2H5 BBX-201ENST00000325805 3517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
USP35Q9P2H5 MIR16-2-201ENST00000362117 81 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
USP35Q9P2H5 TNPO1P1-201ENST00000423641 1138 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
USP35Q9P2H5 MTCO2P1-201ENST00000424648 477 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
USP35Q9P2H5 MRPS21P2-201ENST00000424704 264 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
USP35Q9P2H5 SLC36A1-202ENST00000429484 977 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
USP35Q9P2H5 AL390879.2-204ENST00000438602 582 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
USP35Q9P2H5 MTCYBP21-201ENST00000443300 1113 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
USP35Q9P2H5 AC011225.1-201ENST00000457751 369 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
USP35Q9P2H5 RPL32P14-201ENST00000463196 378 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
USP35Q9P2H5 AC023245.1-201ENST00000468501 517 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
USP35Q9P2H5 AL355032.1-201ENST00000472981 438 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
USP35Q9P2H5 AC025459.1-201ENST00000504072 156 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
USP35Q9P2H5 AC121161.1-201ENST00000510606 652 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
USP35Q9P2H5 AC106894.1-201ENST00000511735 451 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
USP35Q9P2H5 RNU6-1308P-201ENST00000516817 103 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
USP35Q9P2H5 DCN-209ENST00000546745 1026 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
USP35Q9P2H5 AC079907.2-202ENST00000547004 423 ntTSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
USP35Q9P2H5 AC020661.4-201ENST00000561388 500 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
USP35Q9P2H5 AC007842.1-201ENST00000597336 2039 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
USP35Q9P2H5 PRKCQ-AS1-213ENST00000613985 883 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
USP35Q9P2H5 AL359513.1-201ENST00000614364 557 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
USP35Q9P2H5 LPAR4-205ENST00000614823 2155 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.99□□□□□ -1.13
USP35Q9P2H5 AL137067.2-201ENST00000621202 131 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
USP35Q9P2H5 AL049777.1-201ENST00000622740 518 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
USP35Q9P2H5 PRKCQ-AS1-218ENST00000624974 1132 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
USP35Q9P2H5 SLC8A1-AS1-239ENST00000631142 623 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
USP35Q9P2H5 PDE4D-226ENST00000546160 7690 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
USP35Q9P2H5 TRIQK-206ENST00000518748 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
USP35Q9P2H5 NDRG3-201ENST00000349004 2964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
USP35Q9P2H5 HHLA2-211ENST00000619531 2548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
USP35Q9P2H5 R3HDM1-202ENST00000409478 4272 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
USP35Q9P2H5 ECHDC1-222ENST00000531967 2585 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
USP35Q9P2H5 MROH2B-203ENST00000506092 3745 ntTSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
USP35Q9P2H5 OR4K13-202ENST00000641664 5980 ntAPPRIS P1 BASIC7.99□□□□□ -1.13
USP35Q9P2H5 ROR1-AS1-202ENST00000424995 2189 ntTSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
USP35Q9P2H5 AC127164.1-201ENST00000548738 4196 ntTSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
USP35Q9P2H5 RGPD2-203ENST00000638730 5306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
USP35Q9P2H5 N4BP2L2-204ENST00000399396 2872 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
USP35Q9P2H5 AP001541.1-201ENST00000623322 1904 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
USP35Q9P2H5 RIMS1-205ENST00000414192 1787 ntTSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
USP35Q9P2H5 OR4K17-201ENST00000315543 1032 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
USP35Q9P2H5 EMSY-201ENST00000334736 5508 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
USP35Q9P2H5 TEX36-201ENST00000368821 922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
USP35Q9P2H5 ATP5HP3-201ENST00000396994 486 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
USP35Q9P2H5 AL590432.1-201ENST00000420071 566 ntTSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
USP35Q9P2H5 AC009506.2-201ENST00000420635 840 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
USP35Q9P2H5 RPS15AP30-201ENST00000420976 390 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
USP35Q9P2H5 VN1R42P-201ENST00000424651 344 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
USP35Q9P2H5 AL391704.3-201ENST00000425365 831 ntTSL 3 BASIC7.98□□□□□ -1.13
USP35Q9P2H5 FOCAD-AS1-201ENST00000439876 359 ntTSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
USP35Q9P2H5 AL390119.1-201ENST00000440329 312 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
USP35Q9P2H5 RPS27P5-201ENST00000444247 244 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
USP35Q9P2H5 GXYLT1P1-201ENST00000446657 490 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
USP35Q9P2H5 LRRC69-202ENST00000448384 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
USP35Q9P2H5 RN7SL860P-201ENST00000473738 223 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
USP35Q9P2H5 MOSPD2-206ENST00000497603 775 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
USP35Q9P2H5 C5orf64-204ENST00000507461 535 ntTSL 4 BASIC7.98□□□□□ -1.13
USP35Q9P2H5 C1GALT1P2-201ENST00000510813 1104 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
USP35Q9P2H5 RN7SKP141-201ENST00000516167 338 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
USP35Q9P2H5 LGALS8-217ENST00000525042 903 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
USP35Q9P2H5 AC090692.1-202ENST00000525363 607 ntTSL 4 BASIC7.98□□□□□ -1.13
USP35Q9P2H5 HMGN2P36-201ENST00000529541 409 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
USP35Q9P2H5 AL049872.1-201ENST00000556323 322 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
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