Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 PWRN1-204ENST00000565241 480 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
NRF1Q16656 LINC02137-203ENST00000567448 930 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
NRF1Q16656 AP000769.2-201ENST00000602344 396 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
NRF1Q16656 AL691477.1-201ENST00000624398 162 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
NRF1Q16656 LINC00254-202ENST00000633813 439 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
NRF1Q16656 MIR193BHG-214ENST00000641765 509 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
NRF1Q16656 ERC2-201ENST00000288221 6138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
NRF1Q16656 ADGRG4-202ENST00000394141 8971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
NRF1Q16656 LINS1-214ENST00000561308 1612 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
NRF1Q16656 URI1-201ENST00000360605 1579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
NRF1Q16656 ABCA6-206ENST00000590645 1511 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
NRF1Q16656 A1CF-207ENST00000395495 9400 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
NRF1Q16656 KMO-202ENST00000366557 4888 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
NRF1Q16656 EPS8-207ENST00000540613 2204 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
NRF1Q16656 PALMD-201ENST00000263174 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
NRF1Q16656 AC245407.1-201ENST00000621489 2538 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
NRF1Q16656 AC090220.1-201ENST00000593078 1699 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
NRF1Q16656 ADGB-205ENST00000397944 5325 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
NRF1Q16656 AL731566.1-201ENST00000620490 1937 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
NRF1Q16656 TRAJ4-201ENST00000390533 63 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
NRF1Q16656 MYL12B-202ENST00000400175 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
NRF1Q16656 HMGB1P20-201ENST00000402555 677 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
NRF1Q16656 MIRLET7DHG-201ENST00000416309 1294 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
NRF1Q16656 Z98742.1-201ENST00000419801 632 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
NRF1Q16656 AL513188.1-201ENST00000421167 614 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
NRF1Q16656 AL390115.1-201ENST00000425271 423 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
NRF1Q16656 AC113412.1-201ENST00000425840 504 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
NRF1Q16656 AL354896.1-201ENST00000430214 561 ntTSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.6
NRF1Q16656 AC073062.1-201ENST00000434509 455 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
NRF1Q16656 AL133247.1-201ENST00000435713 646 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
NRF1Q16656 AL592494.1-201ENST00000437523 309 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
NRF1Q16656 CYCSP24-201ENST00000445119 316 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
NRF1Q16656 AC068489.1-201ENST00000453706 261 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
NRF1Q16656 RNA5SP103-201ENST00000459503 118 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
NRF1Q16656 RN7SL177P-201ENST00000476596 299 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
NRF1Q16656 AC093827.1-201ENST00000480094 861 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
NRF1Q16656 RPS4XP14-201ENST00000493072 781 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
NRF1Q16656 AC008517.1-201ENST00000502383 585 ntTSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.6
NRF1Q16656 AC139718.2-201ENST00000506068 481 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
NRF1Q16656 AC109481.1-201ENST00000509173 282 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
NRF1Q16656 LINC02147-201ENST00000509367 807 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
NRF1Q16656 MINCR-206ENST00000524335 499 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
NRF1Q16656 AP003086.3-201ENST00000527030 365 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
NRF1Q16656 AC027544.3-201ENST00000535082 757 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
NRF1Q16656 AC090023.2-201ENST00000540875 545 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
NRF1Q16656 VPS29-210ENST00000552130 1057 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
NRF1Q16656 LINC00687-203ENST00000558175 696 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
NRF1Q16656 AC016839.1-201ENST00000578162 867 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
NRF1Q16656 NPM1P45-201ENST00000583151 559 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
NRF1Q16656 AC022031.2-203ENST00000587346 565 ntTSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.6
NRF1Q16656 AC100775.1-201ENST00000590942 522 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
NRF1Q16656 AC024563.1-201ENST00000601860 618 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
NRF1Q16656 XIST-210ENST00000602863 775 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
NRF1Q16656 AC244107.2-201ENST00000611773 76 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
NRF1Q16656 AC022467.1-201ENST00000614738 749 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
NRF1Q16656 AC037198.3-201ENST00000616754 526 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
NRF1Q16656 AC099654.6-201ENST00000636487 512 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
NRF1Q16656 AC092375.1-202ENST00000639452 404 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
NRF1Q16656 SAMSN1-203ENST00000400566 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
NRF1Q16656 DAZ4-205ENST00000440066 1891 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
NRF1Q16656 DAZ1-206ENST00000620725 1891 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
NRF1Q16656 SRRM1-203ENST00000447431 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
NRF1Q16656 OR5AQ1P-203ENST00000641818 1529 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
NRF1Q16656 GYS2-201ENST00000261195 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
NRF1Q16656 SERPINB7-207ENST00000546027 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
NRF1Q16656 PINCR-201ENST00000440955 2228 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
NRF1Q16656 AC063976.2-201ENST00000425667 3556 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
NRF1Q16656 FAM135A-210ENST00000505868 5173 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
NRF1Q16656 AC079298.1-201ENST00000625026 1619 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
NRF1Q16656 STX3-208ENST00000641815 3236 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
NRF1Q16656 SRRM1P3-201ENST00000426911 2678 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
NRF1Q16656 GABRA2-205ENST00000507069 1562 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
NRF1Q16656 AC011447.7-201ENST00000624228 1590 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
NRF1Q16656 TCHHL1-201ENST00000368806 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
NRF1Q16656 LRP6-201ENST00000261349 10020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
NRF1Q16656 OR4K13-201ENST00000315693 915 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
NRF1Q16656 RNA5SP394-201ENST00000364216 119 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
NRF1Q16656 LEMD1-203ENST00000367152 741 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
NRF1Q16656 PLIN2-202ENST00000380464 655 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
NRF1Q16656 RPL34-203ENST00000394668 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
NRF1Q16656 AC005323.2-201ENST00000399342 583 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
NRF1Q16656 AL050305.1-201ENST00000399993 1230 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
NRF1Q16656 RMRPP5-201ENST00000411156 267 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
NRF1Q16656 EEF1A1P29-201ENST00000416082 1096 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
NRF1Q16656 AC093155.2-201ENST00000420734 937 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
NRF1Q16656 PCBP1-AS1-232ENST00000442040 1111 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
NRF1Q16656 MYO5BP2-201ENST00000449815 1277 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
NRF1Q16656 LRRC37A14P-201ENST00000452297 462 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
NRF1Q16656 VDAC2P4-201ENST00000452925 711 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
NRF1Q16656 AP000547.1-201ENST00000454360 617 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
NRF1Q16656 LINC01436-201ENST00000457157 1048 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
NRF1Q16656 AC111000.5-201ENST00000506559 1178 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
NRF1Q16656 ASNSP4-201ENST00000511103 447 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
NRF1Q16656 AC139722.1-201ENST00000512502 782 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
NRF1Q16656 ZCCHC10-210ENST00000513848 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
NRF1Q16656 ATP5LP3-201ENST00000514223 304 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
NRF1Q16656 AC079209.1-202ENST00000521953 522 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
NRF1Q16656 GTF2IP11-201ENST00000526931 420 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
NRF1Q16656 AC016257.1-201ENST00000550088 641 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
NRF1Q16656 AL390816.1-201ENST00000553990 322 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.7 ms