Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 LINC01297-204ENST00000621052 4222 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 NFX1-201ENST00000318524 3513 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 AC113146.2-201ENST00000560743 1961 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 PLCZ1-201ENST00000266505 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 PCYT1B-201ENST00000356768 1289 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 RN7SKP189-201ENST00000365042 330 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 MCTS1-202ENST00000371317 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 RNA5SP176-201ENST00000390956 110 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 LDHAP5-201ENST00000394996 622 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 AL033519.1-201ENST00000407266 307 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 AL445213.1-201ENST00000412589 747 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 BTF3L4P1-201ENST00000413813 468 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 AL512622.1-201ENST00000414106 481 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 AF178030.1-201ENST00000415088 402 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 AC007179.1-201ENST00000415159 438 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 TEX38-202ENST00000415500 566 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 GRM7-AS3-202ENST00000417482 454 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 SMARCE1P1-201ENST00000417747 1186 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 RPP40P1-201ENST00000426762 456 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 LINC00595-203ENST00000432742 683 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 LINC01291-203ENST00000435984 565 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 AC012445.1-201ENST00000442831 607 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 AC016772.1-201ENST00000444170 1261 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 TPTE2P6-202ENST00000445572 1007 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 LIX1L-AS1-207ENST00000448561 347 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 RN7SL372P-201ENST00000461982 298 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 AC005165.2-201ENST00000466070 380 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 LINC00973-201ENST00000473756 962 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 RN7SL790P-201ENST00000474043 298 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 SNX18P23-201ENST00000510867 677 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 AC109361.2-202ENST00000512514 483 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 AC092436.2-201ENST00000515188 411 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 MINOS1P4-201ENST00000515470 318 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 RNU6-1225P-201ENST00000516336 65 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 FBXO16-207ENST00000518734 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 AP002428.1-201ENST00000527345 380 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 NAV2-IT1-201ENST00000528204 506 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 CREBZF-209ENST00000534224 545 ntTSL 4 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 PARPBP-209ENST00000537257 976 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 AC156455.1-201ENST00000538790 851 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 AC140063.1-201ENST00000541343 259 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 AC023161.2-201ENST00000551218 780 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 PSMA4-204ENST00000558094 651 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 LRRC36-205ENST00000563189 2104 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 AC007496.1-201ENST00000565641 739 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 LINC00556-201ENST00000569603 412 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 MIR378C-201ENST00000578683 81 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 AC138207.5-201ENST00000579561 409 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 MIR4312-201ENST00000579909 76 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 AC023421.2-202ENST00000586213 547 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 LINC01028-201ENST00000586373 1045 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 LINC02028-206ENST00000593326 810 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 AL031985.2-201ENST00000600955 480 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
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PDCD1Q15116 AC073862.4-201ENST00000622982 854 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 AC015726.3-201ENST00000624501 418 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 PCDHB2-203ENST00000624874 565 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 ATE1-AS1-202ENST00000636460 506 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 FLRT3-201ENST00000341420 3971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 CX3CR1-202ENST00000399220 3106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 PLS1-211ENST00000497002 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 RAB9B-201ENST00000243298 3748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 FOXM1-202ENST00000359843 3315 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 AL353784.1-201ENST00000422842 2300 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 ECHDC1-210ENST00000454859 2341 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 UPF2-201ENST00000356352 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 AC084816.1-210ENST00000540895 1920 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 NEDD9-202ENST00000379446 4536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 DNAJC10-208ENST00000537515 1669 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
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PDCD1Q15116 FAM13C-219ENST00000621119 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 PSG1-202ENST00000312439 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 COG2-209ENST00000534989 2963 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 AL391704.1-201ENST00000422206 2368 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 TMED10-201ENST00000303575 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 RFX4-203ENST00000392842 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 CRYBA1-201ENST00000225387 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 IL2-201ENST00000226730 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 SCG5-201ENST00000300175 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 CRYGS-201ENST00000307944 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 AC008549.2-201ENST00000333482 706 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 IGHV2-26-201ENST00000390611 381 ntAPPRIS P1 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 LINC00354-201ENST00000412119 347 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 MTND4LP17-201ENST00000414607 293 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 KCND3-AS1-201ENST00000419258 383 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 AP000221.1-201ENST00000419694 1046 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 GRK5-IT1-201ENST00000421206 400 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 LINC00575-201ENST00000426551 910 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 AC010148.1-201ENST00000427619 707 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 AL590128.1-201ENST00000433407 286 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 LINC01078-201ENST00000434832 387 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 AL139161.2-201ENST00000438371 740 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 ELOCP8-201ENST00000439309 332 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 AC093155.1-201ENST00000440164 826 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 ELOCP15-201ENST00000442090 332 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 AL591503.2-201ENST00000442314 1005 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 CRYGGP-201ENST00000443337 145 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 YWHAQP9-201ENST00000445891 512 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 KF459542.1-201ENST00000450908 553 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 OR52E7P-201ENST00000452394 933 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
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