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| FHL3 | Q13643 | AC123769.1-201 | ENST00000530992 | 3192 nt | BASIC | 5.03 | □□□□□ -1.6 | | |
| FHL3 | Q13643 | MCTP2-201 | ENST00000357742 | 7555 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 5.03 | □□□□□ -1.6 | | |
| FHL3 | Q13643 | GON4L-204 | ENST00000437809 | 7713 nt | APPRIS P3 TSL 5 BASIC | 5.03 | □□□□□ -1.6 | | |
| FHL3 | Q13643 | LINC01011-204 | ENST00000605901 | 1573 nt | TSL 2 BASIC | 5.03 | □□□□□ -1.6 | | |
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| FHL3 | Q13643 | AC243654.3-201 | ENST00000617427 | 735 nt | TSL 5 BASIC | 5.02 | □□□□□ -1.61 | | |
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| FHL3 | Q13643 | LINC00969-332 | ENST00000630874 | 738 nt | TSL 5 BASIC | 5.02 | □□□□□ -1.61 | | |