Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Length 790 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 DARS-AS1-220ENST00000607985 660 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CDH18Q13634 AL139124.1-201ENST00000609123 421 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CDH18Q13634 Metazoa_SRP.170-201ENST00000616060 254 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CDH18Q13634 AC005618.4-201ENST00000625053 554 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CDH18Q13634 MYOCOS-202ENST00000636788 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CDH18Q13634 AP000550.3-201ENST00000637734 379 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CDH18Q13634 OR52B5P-202ENST00000641118 1110 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CDH18Q13634 SAMMSON-227ENST00000642114 1199 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CDH18Q13634 AC114774.1-201ENST00000507410 1770 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CDH18Q13634 ESRRG-219ENST00000487276 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
CDH18Q13634 ZNF568-214ENST00000616085 3542 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CDH18Q13634 CUL4AP1-201ENST00000514750 1863 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CDH18Q13634 OR55B1P-203ENST00000641518 2602 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CDH18Q13634 C5-201ENST00000223642 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
CDH18Q13634 LMO3-225ENST00000541295 3498 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CDH18Q13634 AC087473.1-201ENST00000561320 2471 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
CDH18Q13634 STAU2-210ENST00000521210 1950 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CDH18Q13634 OR8A1-203ENST00000641670 5709 ntAPPRIS P1 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CDH18Q13634 TNRC6B-206ENST00000454349 18279 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CDH18Q13634 AC022893.1-201ENST00000517664 3549 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CDH18Q13634 OR2J3-202ENST00000641151 3297 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CDH18Q13634 RN7SKP186-201ENST00000365371 303 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CDH18Q13634 USMG5-203ENST00000369811 635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CDH18Q13634 IGLV7-43-201ENST00000390298 385 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CDH18Q13634 DBIP1-201ENST00000401435 260 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CDH18Q13634 AC244453.4-201ENST00000419150 388 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CDH18Q13634 G6PC2-203ENST00000421979 494 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CDH18Q13634 MRPS21P2-201ENST00000424704 264 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CDH18Q13634 RPL7P40-201ENST00000481703 745 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CDH18Q13634 TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 488 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CDH18Q13634 TMED11P-203ENST00000502630 533 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CDH18Q13634 AC016651.1-201ENST00000502680 822 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CDH18Q13634 AC012629.1-201ENST00000503953 342 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CDH18Q13634 HAPLN1-206ENST00000514416 1145 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CDH18Q13634 SNORA48.9-201ENST00000516419 162 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CDH18Q13634 AC012613.1-201ENST00000522685 387 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CDH18Q13634 ARL6IP1P3-201ENST00000524544 560 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CDH18Q13634 ASB8-202ENST00000535055 657 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CDH18Q13634 YWHABP2-201ENST00000540201 713 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CDH18Q13634 AP000619.2-201ENST00000546014 969 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CDH18Q13634 HAUS8P1-201ENST00000549005 542 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CDH18Q13634 ETFRF1-211ENST00000557540 1259 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CDH18Q13634 AC051619.2-201ENST00000559063 397 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CDH18Q13634 NMNAT1P5-201ENST00000559657 841 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CDH18Q13634 AC087190.2-201ENST00000565648 731 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CDH18Q13634 AC090518.1-202ENST00000568246 578 ntTSL 4 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CDH18Q13634 AC113418.1-201ENST00000569928 517 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
CDH18Q13634 AC109460.2-201ENST00000569974 544 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CDH18Q13634 AL583832.1-201ENST00000603227 784 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CDH18Q13634 AC009027.1-201ENST00000604510 479 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CDH18Q13634 AC138473.1-201ENST00000605717 526 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CDH18Q13634 AC026786.2-201ENST00000606110 392 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CDH18Q13634 AL353770.4-201ENST00000614936 468 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CDH18Q13634 AL590491.2-203ENST00000614969 468 ntTSL 4 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CDH18Q13634 CEP290-202ENST00000397838 2421 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CDH18Q13634 SAMM50P1-201ENST00000455403 1399 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CDH18Q13634 GABRA1-218ENST00000637827 1838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CDH18Q13634 AL031595.2-201ENST00000624215 19071 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CDH18Q13634 MATR3-230ENST00000394800 5513 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CDH18Q13634 PWRN2-202ENST00000567246 4295 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
CDH18Q13634 AIMP1-202ENST00000394701 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
CDH18Q13634 ZNF189-201ENST00000259395 3115 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
CDH18Q13634 LINC01375-201ENST00000428485 1860 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CDH18Q13634 AL161911.1-202ENST00000464488 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CDH18Q13634 FNIP1-202ENST00000307968 6388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CDH18Q13634 CASC1-201ENST00000320267 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
CDH18Q13634 ZNF615-213ENST00000602063 4094 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CDH18Q13634 LINC00598-206ENST00000615947 3541 ntTSL 4 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CDH18Q13634 PPIAP9-201ENST00000403866 498 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CDH18Q13634 SLC19A3-202ENST00000409287 644 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CDH18Q13634 LINC00317-201ENST00000419069 612 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
CDH18Q13634 MAGI2-AS3-204ENST00000426835 738 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CDH18Q13634 AL161457.1-201ENST00000434656 905 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CDH18Q13634 AP000472.1-201ENST00000452500 530 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CDH18Q13634 AC104849.1-201ENST00000462623 405 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CDH18Q13634 AC078828.1-201ENST00000471993 458 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CDH18Q13634 AC010387.1-201ENST00000507526 487 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CDH18Q13634 AC093305.1-201ENST00000514105 522 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CDH18Q13634 AC010261.2-201ENST00000515563 588 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CDH18Q13634 AC084024.3-201ENST00000520598 562 ntTSL 4 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CDH18Q13634 APPL2-203ENST00000546731 684 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CDH18Q13634 MTND2P17-201ENST00000550281 688 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CDH18Q13634 AC011270.1-201ENST00000558606 583 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CDH18Q13634 AC007448.1-201ENST00000582714 234 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CDH18Q13634 VN1R81P-201ENST00000602085 372 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CDH18Q13634 AC005252.1-201ENST00000604518 1063 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CDH18Q13634 AL121612.2-201ENST00000612261 482 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CDH18Q13634 AL356752.1-201ENST00000615844 593 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CDH18Q13634 FGF1-215ENST00000619447 3818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CDH18Q13634 CU634019.2-201ENST00000625184 593 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CDH18Q13634 C15orf54-202ENST00000625107 3078 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
CDH18Q13634 CFH-201ENST00000359637 1454 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
CDH18Q13634 GSTM2-206ENST00000442650 1478 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CDH18Q13634 PCDH15-201ENST00000320301 6845 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
CDH18Q13634 EOGT-208ENST00000540764 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
CDH18Q13634 DECR1-215ENST00000522161 1766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CDH18Q13634 COPB2-205ENST00000507777 3034 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CDH18Q13634 AL160286.3-201ENST00000569644 3294 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CDH18Q13634 AC005005.4-201ENST00000623789 16698 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CDH18Q13634 LRRC8B-201ENST00000330947 7593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
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