Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 AC245884.3-201ENST00000445491 218 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
MKRN4PQ13434 AL035551.1-201ENST00000446931 348 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
MKRN4PQ13434 AC105393.1-202ENST00000449621 598 ntTSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
MKRN4PQ13434 GAS5-221ENST00000450589 632 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
MKRN4PQ13434 AC034195.1-203ENST00000455703 728 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
MKRN4PQ13434 PLGLA-202ENST00000482249 475 ntTSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
MKRN4PQ13434 HNRNPA1P20-201ENST00000484852 955 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
MKRN4PQ13434 AC008592.1-201ENST00000503091 665 ntTSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
MKRN4PQ13434 CTNND2-205ENST00000503622 2982 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
MKRN4PQ13434 AC024958.1-203ENST00000520256 577 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
MKRN4PQ13434 AC007991.1-201ENST00000522680 631 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
MKRN4PQ13434 DACT3-AS1-202ENST00000525008 496 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
MKRN4PQ13434 SERPINA15P-201ENST00000529287 266 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
MKRN4PQ13434 AP006587.2-201ENST00000530696 493 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
MKRN4PQ13434 AC084361.1-201ENST00000537730 607 ntTSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
MKRN4PQ13434 AC022165.1-201ENST00000568771 596 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
MKRN4PQ13434 CD300LF-208ENST00000581500 720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
MKRN4PQ13434 RN7SL246P-201ENST00000584467 296 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
MKRN4PQ13434 AC010620.2-201ENST00000600135 313 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
MKRN4PQ13434 AL031320.1-201ENST00000604177 357 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
MKRN4PQ13434 AC098617.1-203ENST00000609865 277 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
MKRN4PQ13434 AC061709.1-202ENST00000615029 527 ntTSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
MKRN4PQ13434 Metazoa_SRP.192-201ENST00000616260 286 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
MKRN4PQ13434 AC245505.3-201ENST00000616788 358 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
MKRN4PQ13434 AC040978.1-201ENST00000617244 1282 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
MKRN4PQ13434 AC079801.1-201ENST00000623753 388 ntTSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
MKRN4PQ13434 BTBD3-215ENST00000618918 4486 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC9.75□□□□□ -0.85
MKRN4PQ13434 LY86-AS1-201ENST00000429345 1941 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
MKRN4PQ13434 NCAM1-222ENST00000615285 6045 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
MKRN4PQ13434 GDF9-202ENST00000378673 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
MKRN4PQ13434 MED1-202ENST00000394287 2870 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
MKRN4PQ13434 OR1D2-203ENST00000641833 4887 ntAPPRIS P1 BASIC9.75□□□□□ -0.85
MKRN4PQ13434 AL359924.1-201ENST00000450451 3127 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
MKRN4PQ13434 NCAPD2P1-201ENST00000432906 1801 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
MKRN4PQ13434 HEMGN-202ENST00000616898 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
MKRN4PQ13434 EPN1-202ENST00000270460 16219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
MKRN4PQ13434 MSRB3-212ENST00000614640 4270 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
MKRN4PQ13434 CDH17-203ENST00000450165 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
MKRN4PQ13434 ABL2-206ENST00000504405 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
MKRN4PQ13434 PTK2B-201ENST00000346049 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
MKRN4PQ13434 TMPRSS11B-201ENST00000332644 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
MKRN4PQ13434 HIPK2-201ENST00000342645 2937 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
MKRN4PQ13434 KCNJ15-205ENST00000398930 2914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
MKRN4PQ13434 MKI67P1-201ENST00000604297 1460 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
MKRN4PQ13434 CCT5-213ENST00000515390 1728 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
MKRN4PQ13434 ZNF234-204ENST00000592437 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
MKRN4PQ13434 GJA9-201ENST00000357771 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
MKRN4PQ13434 MTA3-201ENST00000405094 1785 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
MKRN4PQ13434 IPO7P2-201ENST00000451446 1750 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
MKRN4PQ13434 Y_RNA.2-201ENST00000362330 96 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
MKRN4PQ13434 Y_RNA.19-201ENST00000362462 99 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
MKRN4PQ13434 Y_RNA.122-201ENST00000363331 96 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
MKRN4PQ13434 MIR613-201ENST00000385248 95 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
MKRN4PQ13434 AC234778.1-201ENST00000399253 370 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
MKRN4PQ13434 RNU4-46P-201ENST00000410818 138 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
MKRN4PQ13434 C14orf2-202ENST00000414262 842 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
MKRN4PQ13434 AC004830.1-201ENST00000420449 285 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
MKRN4PQ13434 NMD3P2-201ENST00000421815 761 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
MKRN4PQ13434 SNHG17-204ENST00000423536 517 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
MKRN4PQ13434 AC090505.2-201ENST00000427064 464 ntTSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
MKRN4PQ13434 RPL3P8-201ENST00000432928 1191 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
MKRN4PQ13434 AP002856.4-201ENST00000441638 569 ntTSL 4 BASIC9.74□□□□□ -0.85
MKRN4PQ13434 AL035417.1-201ENST00000442754 214 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
MKRN4PQ13434 AL772284.1-201ENST00000443421 905 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
MKRN4PQ13434 LINC00704-202ENST00000443994 418 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
MKRN4PQ13434 MTCO3P8-201ENST00000453691 755 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
MKRN4PQ13434 AC239859.3-201ENST00000456469 408 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
MKRN4PQ13434 SNX18P4-201ENST00000456554 838 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
MKRN4PQ13434 PPIAP28-201ENST00000458378 485 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
MKRN4PQ13434 CREM-242ENST00000490511 469 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
MKRN4PQ13434 RPL23AP66-201ENST00000494341 479 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
MKRN4PQ13434 IGKV1-27-201ENST00000498435 382 ntAPPRIS P1 BASIC9.74□□□□□ -0.85
MKRN4PQ13434 AC096754.1-201ENST00000508904 818 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
MKRN4PQ13434 EIF3KP3-201ENST00000514461 639 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
MKRN4PQ13434 STX18-IT1-201ENST00000515487 542 ntTSL 4 BASIC9.74□□□□□ -0.85
MKRN4PQ13434 RNU2-10P-201ENST00000516375 211 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
MKRN4PQ13434 SCARNA20.3-201ENST00000516913 131 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
MKRN4PQ13434 IGHVII-26-2-201ENST00000518751 325 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
MKRN4PQ13434 AC007527.1-202ENST00000543347 382 ntTSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
MKRN4PQ13434 FAM174B-202ENST00000553393 495 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
MKRN4PQ13434 AC023906.2-201ENST00000558343 462 ntTSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
MKRN4PQ13434 SUB1P3-201ENST00000564581 315 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
MKRN4PQ13434 AC113418.1-201ENST00000569928 517 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
MKRN4PQ13434 RN7SL203P-201ENST00000579600 296 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
MKRN4PQ13434 AC005722.3-201ENST00000580884 446 ntTSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
MKRN4PQ13434 AC018697.1-202ENST00000582650 592 ntTSL 4 BASIC9.74□□□□□ -0.85
MKRN4PQ13434 AC017100.2-201ENST00000584628 355 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
MKRN4PQ13434 TRIM37-212ENST00000584889 353 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
MKRN4PQ13434 BNIP3P15-201ENST00000604600 301 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
MKRN4PQ13434 LINC02018-202ENST00000608707 445 ntTSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
MKRN4PQ13434 AL031666.3-201ENST00000609320 1006 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
MKRN4PQ13434 MIR7156-201ENST00000620979 60 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
MKRN4PQ13434 AC011155.2-201ENST00000623202 216 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
MKRN4PQ13434 CDRT1-208ENST00000630868 794 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
MKRN4PQ13434 AC100756.3-201ENST00000618455 1816 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
MKRN4PQ13434 GC-208ENST00000513476 1567 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
MKRN4PQ13434 MARF1-202ENST00000540441 7105 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
MKRN4PQ13434 NBPF19-203ENST00000578189 5034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
MKRN4PQ13434 LRRC4C-204ENST00000530763 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
MKRN4PQ13434 NOS1-203ENST00000344089 4340 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.4 ms