Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 AC005828.7-201ENST00000607331 556 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
IFFO1Q0D2I5 Z99755.2-201ENST00000610215 364 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
IFFO1Q0D2I5 PXT1-202ENST00000619547 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
IFFO1Q0D2I5 RPS6KA5-207ENST00000614987 26795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
IFFO1Q0D2I5 PTPN13-201ENST00000316707 7546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
IFFO1Q0D2I5 FAM133A-202ENST00000332647 3159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
IFFO1Q0D2I5 EIF4EBP2-201ENST00000373218 7257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
IFFO1Q0D2I5 AP3B1-204ENST00000519295 3986 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
IFFO1Q0D2I5 EIF3H-209ENST00000521861 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
IFFO1Q0D2I5 OR5A1-202ENST00000641045 8612 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
IFFO1Q0D2I5 OBSCN-204ENST00000366707 26772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
IFFO1Q0D2I5 GABRA2-211ENST00000514090 3401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
IFFO1Q0D2I5 FHL5-201ENST00000326771 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
IFFO1Q0D2I5 C1orf140-202ENST00000439004 4340 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
IFFO1Q0D2I5 OR8H2-201ENST00000313503 3088 ntAPPRIS P2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
IFFO1Q0D2I5 DDR2-202ENST00000367922 10160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
IFFO1Q0D2I5 ING3-205ENST00000445699 1723 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
IFFO1Q0D2I5 STAG2-204ENST00000371157 5991 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
IFFO1Q0D2I5 UGT2B26P-201ENST00000508672 1613 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
IFFO1Q0D2I5 AC104966.1-201ENST00000467010 1464 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
IFFO1Q0D2I5 ELF2-203ENST00000379550 3278 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
IFFO1Q0D2I5 BTBD10P1-201ENST00000549824 1352 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
IFFO1Q0D2I5 PTPRO-204ENST00000445537 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
IFFO1Q0D2I5 RPL34-203ENST00000394668 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
IFFO1Q0D2I5 AL034417.1-201ENST00000399343 800 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
IFFO1Q0D2I5 OR7E101P-201ENST00000400428 513 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
IFFO1Q0D2I5 AL390316.1-201ENST00000406279 553 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
IFFO1Q0D2I5 GAPDHP42-201ENST00000406848 981 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
IFFO1Q0D2I5 MIR1203-201ENST00000408812 85 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
IFFO1Q0D2I5 EIF4A1P1-201ENST00000420241 934 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
IFFO1Q0D2I5 AL035660.1-201ENST00000422041 222 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
IFFO1Q0D2I5 NAP1L4P2-201ENST00000425958 899 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
IFFO1Q0D2I5 AC127526.2-201ENST00000426436 775 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
IFFO1Q0D2I5 GSTM5P1-201ENST00000434751 660 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
IFFO1Q0D2I5 AL162386.2-201ENST00000442428 457 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
IFFO1Q0D2I5 AL450996.1-201ENST00000445574 1202 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
IFFO1Q0D2I5 AC093166.2-201ENST00000455969 1017 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
IFFO1Q0D2I5 ACA64.1-201ENST00000459171 127 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
IFFO1Q0D2I5 AC058823.1-201ENST00000485315 474 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
IFFO1Q0D2I5 RN7SL423P-201ENST00000486202 304 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
IFFO1Q0D2I5 AC093607.1-202ENST00000499715 559 ntTSL 4 BASIC5.34□□□□□ -1.55
IFFO1Q0D2I5 LINC02374-201ENST00000503637 743 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
IFFO1Q0D2I5 ZFPM2-AS1-201ENST00000509144 542 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
IFFO1Q0D2I5 OR5H7P-201ENST00000514084 930 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
IFFO1Q0D2I5 RN7SKP99-201ENST00000517028 307 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
IFFO1Q0D2I5 AC022882.1-201ENST00000532142 501 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
IFFO1Q0D2I5 AC079905.1-201ENST00000549280 475 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
IFFO1Q0D2I5 UBA2-208ENST00000592791 910 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
IFFO1Q0D2I5 AC010320.2-201ENST00000593857 551 ntTSL 4 BASIC5.34□□□□□ -1.55
IFFO1Q0D2I5 SSX4B-201ENST00000595235 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
IFFO1Q0D2I5 SSX4-201ENST00000595689 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
IFFO1Q0D2I5 AC012616.1-201ENST00000600294 197 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
IFFO1Q0D2I5 AC233280.2-201ENST00000603917 1070 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
IFFO1Q0D2I5 AC005252.1-201ENST00000604518 1063 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
IFFO1Q0D2I5 AL138900.3-201ENST00000607010 629 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
IFFO1Q0D2I5 AL353600.1-201ENST00000608148 251 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
IFFO1Q0D2I5 OR7M1P-201ENST00000608946 533 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
IFFO1Q0D2I5 AC097505.1-201ENST00000610199 565 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
IFFO1Q0D2I5 Metazoa_SRP.207-201ENST00000612254 285 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
IFFO1Q0D2I5 LINC01338-201ENST00000627179 632 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
IFFO1Q0D2I5 MTERF1-201ENST00000351870 1997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
IFFO1Q0D2I5 ARHGEF6-203ENST00000370622 4779 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
IFFO1Q0D2I5 SMG1P3-204ENST00000520823 3194 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.56
IFFO1Q0D2I5 TCHHL1-201ENST00000368806 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
IFFO1Q0D2I5 KIF23-206ENST00000558585 2296 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.56
IFFO1Q0D2I5 FGF12-204ENST00000445105 5406 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
IFFO1Q0D2I5 LYARP1-201ENST00000436977 1501 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
IFFO1Q0D2I5 CNTN1-202ENST00000348761 3328 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
IFFO1Q0D2I5 OR4E1-202ENST00000641792 3742 ntAPPRIS P5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
IFFO1Q0D2I5 DDX18P4-201ENST00000511690 1966 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
IFFO1Q0D2I5 PATL1-201ENST00000300146 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
IFFO1Q0D2I5 FGD4-210ENST00000525053 2925 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
IFFO1Q0D2I5 SDC2-204ENST00000519914 1318 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
IFFO1Q0D2I5 PTPN13-202ENST00000411767 8119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
IFFO1Q0D2I5 OR8H3-201ENST00000313472 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.33□□□□□ -1.56
IFFO1Q0D2I5 RNU1-150P-201ENST00000362491 162 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
IFFO1Q0D2I5 S100A9-201ENST00000368738 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
IFFO1Q0D2I5 FETUB-203ENST00000382136 1040 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
IFFO1Q0D2I5 SEPT7P2-202ENST00000398921 823 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
IFFO1Q0D2I5 AC002524.1-201ENST00000411687 547 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
IFFO1Q0D2I5 AL136368.1-201ENST00000416249 401 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
IFFO1Q0D2I5 AL161722.2-201ENST00000434731 981 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
IFFO1Q0D2I5 CLUHP1-201ENST00000435012 1190 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
IFFO1Q0D2I5 AC084149.2-201ENST00000438443 797 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
IFFO1Q0D2I5 AL583854.1-201ENST00000438818 613 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
IFFO1Q0D2I5 PARGP1-202ENST00000440803 790 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
IFFO1Q0D2I5 AL445433.1-201ENST00000457507 257 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
IFFO1Q0D2I5 AC093890.1-201ENST00000502554 540 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
IFFO1Q0D2I5 AC091874.2-201ENST00000505889 720 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
IFFO1Q0D2I5 AC138409.2-202ENST00000507274 458 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
IFFO1Q0D2I5 NACAP5-201ENST00000509863 636 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
IFFO1Q0D2I5 RNU2-45P-201ENST00000516068 187 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
IFFO1Q0D2I5 IGHVIII-11-1-201ENST00000522733 267 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
IFFO1Q0D2I5 AP001266.2-201ENST00000534505 464 ntTSL 4 BASIC5.33□□□□□ -1.56
IFFO1Q0D2I5 AC016257.1-201ENST00000550088 641 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
IFFO1Q0D2I5 IGBP1P1-201ENST00000554337 1009 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
IFFO1Q0D2I5 AC009554.1-201ENST00000559251 399 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
IFFO1Q0D2I5 CYCSP38-201ENST00000559840 322 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
IFFO1Q0D2I5 USP32P2-207ENST00000608376 253 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
IFFO1Q0D2I5 FAM72A-201ENST00000341209 1774 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
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