Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 TMPRSS11BNL-202ENST00000510782 3202 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 LINC01152-201ENST00000472655 3578 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 PIK3C2A-201ENST00000265970 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 PARP4P2-201ENST00000446672 3326 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 ZC3H7A-214ENST00000575984 2632 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 C17orf78-203ENST00000611038 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 FILIP1L-202ENST00000354552 3970 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 AL359715.3-201ENST00000569267 2123 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 AC127164.1-201ENST00000548738 4196 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 UGT2B10-202ENST00000458688 1424 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 UTP15-208ENST00000543251 4922 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 OR10A6-204ENST00000642108 6104 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 ADGRL3-210ENST00000508946 4758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 AC092070.2-203ENST00000598377 3644 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 ESRRG-206ENST00000366938 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 APOH-201ENST00000205948 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 RN7SKP162-201ENST00000363605 345 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 G6PC2-202ENST00000375363 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 RNU6-468P-201ENST00000384003 109 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 TRBV23-1-201ENST00000390396 347 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 NPM1P4-201ENST00000414095 812 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 AL158827.1-201ENST00000416300 391 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 AL391704.2-201ENST00000418379 981 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 LINC02246-202ENST00000418954 717 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 AC009506.2-201ENST00000420635 840 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 Z84478.1-201ENST00000438230 1219 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 AL158828.1-201ENST00000438582 197 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 AL512593.1-201ENST00000444758 779 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 AC044797.1-201ENST00000445744 679 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 LINC01376-204ENST00000449124 626 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 AL445238.1-201ENST00000450029 712 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 AC012355.1-201ENST00000450290 769 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 RPL7P61-201ENST00000451721 751 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 HMGB1P26-201ENST00000452520 628 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 CYCSP20-201ENST00000473154 315 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 EIF1P7-201ENST00000487533 337 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 AC005412.2-201ENST00000492004 341 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 OR5H3P-201ENST00000502817 919 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 AC008427.1-201ENST00000503102 655 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 AC008629.2-201ENST00000503783 483 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 AC138866.2-201ENST00000508650 584 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 AC090103.1-201ENST00000520386 485 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 HDAC2-AS2-217ENST00000523087 493 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 AC105177.1-201ENST00000523110 555 ntTSL 4 BASIC5.75□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 OR8K4P-201ENST00000534608 872 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 AL590385.2-201ENST00000537821 553 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 MRE11-209ENST00000540013 1212 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 AC005906.2-204ENST00000541095 481 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 LINC02399-201ENST00000547094 400 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 AL512310.9-201ENST00000553311 948 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 AC090888.2-201ENST00000559765 1144 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 AC009113.2-201ENST00000563182 403 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 AC136944.1-201ENST00000567464 560 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 TMEM159-205ENST00000572599 713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 AC103808.4-201ENST00000577258 391 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 AL136311.1-213ENST00000586466 520 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 AC002398.1-201ENST00000589397 427 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 UBA52-209ENST00000597451 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 AL592494.3-201ENST00000609485 464 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 PIGX-210ENST00000639143 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 AC087565.3-203ENST00000641018 837 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 ANGPTL5-201ENST00000334289 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 SYNJ2BP-201ENST00000256366 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 PLEKHA5-202ENST00000424268 4391 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 PMFBP1-207ENST00000537465 3935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 SYCP1-201ENST00000369518 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 SERPINB7-207ENST00000546027 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 KCNMA1-AS1-202ENST00000429850 3566 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 AP002512.4-202ENST00000641599 4530 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 SERPINI2-206ENST00000471111 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 TCF12-214ENST00000559710 1314 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 RBM48-202ENST00000481551 4093 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 FRMD6-205ENST00000554167 4176 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 MECOM-202ENST00000433243 3508 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 ARHGEF12-213ENST00000532993 8753 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 PSG4-201ENST00000244295 1629 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 SLC26A7-210ENST00000617233 5257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 LINC00891-201ENST00000627173 4113 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 HORMAD2-202ENST00000403975 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 TPTE2P2-202ENST00000605924 2113 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 CHD2-202ENST00000420239 2221 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 CNTNAP4-205ENST00000476707 4355 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 IL23R-201ENST00000347310 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 ZNF29P-201ENST00000225587 168 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 IFNG-201ENST00000229135 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 OR4S2-201ENST00000312422 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 OR2G3-201ENST00000320002 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 GSTA1-201ENST00000334575 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 OR10R3P-201ENST00000361688 942 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 RNA5SP394-201ENST00000364216 119 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 HMGB1P20-201ENST00000402555 677 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 LINC01829-201ENST00000414404 571 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 NMD3P2-201ENST00000421815 761 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 AL008723.2-201ENST00000426354 562 ntTSL 4 BASIC5.74□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 AL357832.1-201ENST00000427460 420 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 AC092634.2-201ENST00000428146 1010 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 AL162727.2-201ENST00000428429 395 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 AL359878.2-201ENST00000435531 407 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 NANOGP9-201ENST00000439890 892 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 AL121718.1-201ENST00000449463 387 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.5 ms